More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2873 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  100 
 
 		 259 aa  531  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  60.96 
 
 		 252 aa  330  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  61.54 
 
 		 252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  61.13 
 
 		 252 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  59.51 
 
 		 252 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  59.92 
 
 		 252 aa  318  5e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  59.52 
 
 		 253 aa  315  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  61.94 
 
 		 250 aa  312  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  61.13 
 
 		 252 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  57.94 
 
 		 249 aa  300  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  53.82 
 
 		 268 aa  292  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  57.37 
 
 		 260 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  57.37 
 
 		 260 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  57.49 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  54.69 
 
 		 245 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  59 
 
 		 271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  56.9 
 
 		 263 aa  279  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  52.8 
 
 		 263 aa  278  6e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  57.74 
 
 		 263 aa  278  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  56.07 
 
 		 268 aa  276  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  56.07 
 
 		 268 aa  276  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  55.65 
 
 		 268 aa  275  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  53.6 
 
 		 247 aa  271  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  54.18 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  53.6 
 
 		 247 aa  268  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  53.6 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  53.81 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  45.65 
 
 		 279 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  46.24 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  45.49 
 
 		 262 aa  228  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  46.77 
 
 		 282 aa  226  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  49.58 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  46.94 
 
 		 252 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  48.52 
 
 		 236 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  47.11 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  45.66 
 
 		 293 aa  218  8.999999999999998e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  44.83 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  45.59 
 
 		 261 aa  211  7e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  51.54 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  44.66 
 
 		 263 aa  206  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  46.26 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  49.76 
 
 		 235 aa  204  2e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  41.61 
 
 		 278 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  42.99 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  47.34 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  43.58 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  41.27 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  42.61 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  40 
 
 		 290 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  41.45 
 
 		 256 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  39.04 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  40.64 
 
 		 256 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  37.2 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  39.68 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  39.68 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  42.06 
 
 		 317 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  38.82 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  37.17 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0909  signal peptidase I  38.55 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129069  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  36.1 
 
 		 305 aa  146  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  42.86 
 
 		 267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  34.8 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  35.93 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  34.55 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  34.55 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  34.55 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  34.55 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  41.15 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  35.94 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  38.86 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  34.04 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  38.74 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  33.82 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  33.33 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  33.21 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  33.21 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  33.69 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  39.44 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  39.44 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  37.14 
 
 		 297 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  37.14 
 
 		 297 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  37.14 
 
 		 297 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  37.14 
 
 		 297 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  34.05 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  37.39 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  34.85 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  36.73 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  33.69 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  40.83 
 
 		 288 aa  135  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  36.29 
 
 		 298 aa  135  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  37.8 
 
 		 299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  36.73 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  36.73 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  40.89 
 
 		 284 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  36.65 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  34.75 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  38.71 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  32.66 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  38.29 
 
 		 266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  32.03 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>