More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7364 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  100 
 
 		 263 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  92.78 
 
 		 263 aa  500  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  79.85 
 
 		 271 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  78.41 
 
 		 268 aa  431  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  77.82 
 
 		 268 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  77.82 
 
 		 268 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  64.2 
 
 		 263 aa  329  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  66.25 
 
 		 250 aa  329  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  66.8 
 
 		 268 aa  325  4.0000000000000003e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  65.56 
 
 		 252 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  65.7 
 
 		 253 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  63.9 
 
 		 252 aa  316  3e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  64.32 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  64.32 
 
 		 252 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  62.66 
 
 		 252 aa  311  6.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  64.32 
 
 		 252 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  56.85 
 
 		 245 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  56.9 
 
 		 259 aa  279  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  59.83 
 
 		 260 aa  279  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  59.83 
 
 		 260 aa  279  4e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  58.26 
 
 		 260 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  57.32 
 
 		 249 aa  260  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  53.17 
 
 		 247 aa  258  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  53.57 
 
 		 247 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  53.17 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  52.4 
 
 		 247 aa  253  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  52.5 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  50.81 
 
 		 252 aa  231  6e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  47.66 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  48.92 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  49.43 
 
 		 259 aa  216  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  46.89 
 
 		 279 aa  211  7e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  46.49 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  46.89 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  46.56 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  45.85 
 
 		 278 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  43.07 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  47.73 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  47.66 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  45.65 
 
 		 248 aa  194  8.000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  45.68 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  46.15 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  44.21 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  43.83 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  47.32 
 
 		 264 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  46.19 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  43.91 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  43.16 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  42.51 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  45.13 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  41.31 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  40.74 
 
 		 278 aa  161  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  44.7 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  38.89 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  44.74 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  43.06 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  37.76 
 
 		 240 aa  148  9e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  38.65 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  44.17 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0909  signal peptidase I  40.44 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129069  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  40.72 
 
 		 322 aa  146  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  39.91 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  40.09 
 
 		 299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  40 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  39.91 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  39.91 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  42.27 
 
 		 266 aa  142  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  38.5 
 
 		 322 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  39.91 
 
 		 297 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  36.78 
 
 		 324 aa  142  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  39.91 
 
 		 297 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  38.36 
 
 		 297 aa  141  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  38.36 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  39.73 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  41.63 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  38.36 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  38.36 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  38.36 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  35.37 
 
 		 325 aa  139  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  40.58 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  39.91 
 
 		 297 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  39.91 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  40.25 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  40.29 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  38.97 
 
 		 325 aa  138  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  36.46 
 
 		 324 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  39.46 
 
 		 305 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  36.46 
 
 		 324 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  36.46 
 
 		 324 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  36.46 
 
 		 324 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  36.46 
 
 		 324 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  36 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  36.1 
 
 		 324 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  39.81 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  36.1 
 
 		 324 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  39.81 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  39.81 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  37.04 
 
 		 324 aa  136  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  39.81 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  39.81 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>