More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0892 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  100 
 
 		 256 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  79.3 
 
 		 256 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  75.78 
 
 		 255 aa  401  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  75 
 
 		 256 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  68.9 
 
 		 264 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  48.47 
 
 		 245 aa  211  9e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  45.53 
 
 		 268 aa  189  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  44.57 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  46.51 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  41.24 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  43.16 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  43.02 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  41.42 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  43.67 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  42.57 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  43.19 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  44.14 
 
 		 250 aa  178  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  43.8 
 
 		 252 aa  178  9e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  47.09 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  43.16 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  44.03 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  43.16 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  42.74 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  45.26 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  43.39 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  41.42 
 
 		 262 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  40.15 
 
 		 268 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  38.67 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  40.15 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  40.15 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  40.23 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  39.06 
 
 		 247 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  40 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  40 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  40.5 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  44.69 
 
 		 255 aa  165  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  40.48 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  38.55 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  36.72 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  37.2 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  42.2 
 
 		 270 aa  155  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  37.5 
 
 		 278 aa  155  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0909  signal peptidase I  38.35 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129069  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  36.06 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  35.55 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  42.78 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  39.65 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  35.51 
 
 		 282 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  43 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  40 
 
 		 286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  40 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  42.78 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  37.64 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  39.92 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  43.19 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  40.27 
 
 		 287 aa  135  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  35.55 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  37.23 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  40.93 
 
 		 284 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  40.93 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  35.68 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  36.89 
 
 		 299 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  39.13 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  40.28 
 
 		 283 aa  125  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  39.81 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  39.23 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  39.23 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  39.81 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  38.86 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  35.71 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  41.35 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  35.27 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  39.44 
 
 		 267 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  38.03 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  38.03 
 
 		 284 aa  121  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  38.39 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  37.68 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  36.12 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  38.86 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  35.27 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  38.57 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  38.57 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  38.57 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  38.57 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0839  signal peptidase I  41.18 
 
 		 209 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.240301  normal  0.0615193 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  37.56 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  37.56 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  37.56 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  37.56 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  37.45 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  36.65 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  38.94 
 
 		 270 aa  119  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  36.77 
 
 		 297 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  36.77 
 
 		 297 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  38.57 
 
 		 305 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  38.12 
 
 		 305 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  34.27 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  38.12 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  38.12 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  38.12 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>