More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_54350 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  99.3 
 
 
284 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  100 
 
 
284 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  81.63 
 
 
284 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  80.57 
 
 
284 aa  484  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  81.69 
 
 
284 aa  480  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  83.39 
 
 
284 aa  482  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  81.69 
 
 
284 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  81.34 
 
 
284 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  82.04 
 
 
284 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  79.23 
 
 
284 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  75 
 
 
283 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  53.17 
 
 
263 aa  285  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  52.1 
 
 
267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  47.6 
 
 
255 aa  259  3e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  51.11 
 
 
266 aa  257  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  52.22 
 
 
270 aa  255  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  44.83 
 
 
274 aa  247  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  45.31 
 
 
299 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  44.34 
 
 
299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  46.67 
 
 
262 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  46.03 
 
 
288 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  52.34 
 
 
262 aa  236  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  45.39 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  43.85 
 
 
299 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  42.63 
 
 
297 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  45.13 
 
 
305 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  42.95 
 
 
297 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  46.15 
 
 
267 aa  228  6e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  43.18 
 
 
298 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  45.54 
 
 
268 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  41.36 
 
 
305 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  42.27 
 
 
305 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  42.27 
 
 
305 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  42.27 
 
 
305 aa  226  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  40.48 
 
 
325 aa  225  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  44.88 
 
 
248 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  44.88 
 
 
248 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  44.91 
 
 
251 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  43.52 
 
 
321 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  42.54 
 
 
304 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  43.35 
 
 
322 aa  223  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  44.56 
 
 
251 aa  223  3e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  52.36 
 
 
262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  43.71 
 
 
300 aa  221  7e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  41.88 
 
 
305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  45.61 
 
 
256 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  41.27 
 
 
342 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  43.19 
 
 
300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  40.95 
 
 
305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  40.95 
 
 
305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  40.95 
 
 
305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  40.95 
 
 
305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  41.9 
 
 
299 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  43.65 
 
 
322 aa  218  7.999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  43 
 
 
305 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  42.76 
 
 
305 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  42.91 
 
 
305 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  43.23 
 
 
297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  43.23 
 
 
297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  43.23 
 
 
297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  42.57 
 
 
297 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  38.76 
 
 
322 aa  216  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  41.37 
 
 
305 aa  216  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  44.08 
 
 
268 aa  215  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  42.86 
 
 
304 aa  215  7e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  40.9 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  40.9 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  40.9 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  40.9 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  40.9 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  40.9 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  40.9 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  40.9 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  42.91 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  42.57 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  42.9 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1442  Signal peptidase I  43.62 
 
 
264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  42.9 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  42.81 
 
 
301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  44.1 
 
 
301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  43.64 
 
 
304 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  41.79 
 
 
324 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  39.86 
 
 
256 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1373  signal peptidase I  43.26 
 
 
264 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  41.35 
 
 
325 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  41.79 
 
 
324 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  41.79 
 
 
324 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  44.3 
 
 
324 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  40.65 
 
 
324 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  41.79 
 
 
324 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  41.79 
 
 
324 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  39.51 
 
 
256 aa  210  3e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  41.07 
 
 
325 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  43.13 
 
 
322 aa  209  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  43.13 
 
 
322 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  39.77 
 
 
332 aa  208  7e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  40.77 
 
 
322 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  39.77 
 
 
332 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  45.26 
 
 
263 aa  207  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  45.26 
 
 
263 aa  207  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>