More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2639 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  100 
 
 		 252 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  92.86 
 
 		 252 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  92.86 
 
 		 252 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  88.49 
 
 		 252 aa  479  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  86.96 
 
 		 253 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  92.46 
 
 		 252 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  86.9 
 
 		 252 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  71.31 
 
 		 250 aa  378  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  61.13 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  64.08 
 
 		 268 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  63.45 
 
 		 271 aa  319  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  63.67 
 
 		 268 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  63.67 
 
 		 268 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  65.56 
 
 		 263 aa  318  5e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  60.87 
 
 		 268 aa  314  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  63.93 
 
 		 263 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  60.47 
 
 		 260 aa  311  7.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  60.47 
 
 		 260 aa  311  7.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  60.08 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  60.4 
 
 		 249 aa  298  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  58.87 
 
 		 263 aa  297  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  57.44 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  55.56 
 
 		 245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  54.29 
 
 		 247 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  53.09 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  55.79 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  55.37 
 
 		 247 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  50.8 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  52.4 
 
 		 236 aa  239  5e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  49.44 
 
 		 279 aa  238  9e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  49.63 
 
 		 262 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  48.51 
 
 		 262 aa  234  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  50.44 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  43.94 
 
 		 282 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  48.79 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  51.61 
 
 		 235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  47.01 
 
 		 261 aa  218  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  47.97 
 
 		 278 aa  219  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  49.41 
 
 		 263 aa  215  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  50.22 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  45.8 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  47.41 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  41.67 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  46.49 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  46.09 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  43.7 
 
 		 287 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  45.99 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  45.33 
 
 		 256 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  48.04 
 
 		 286 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  43.19 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  45.45 
 
 		 317 aa  165  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  40.24 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  39.41 
 
 		 278 aa  158  9e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  40.68 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  41.63 
 
 		 297 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  41.63 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  41.44 
 
 		 299 aa  148  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  41.18 
 
 		 297 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  41.18 
 
 		 297 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  41.18 
 
 		 297 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  41.95 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  38.75 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  37.83 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  41.18 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  42.79 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  42.79 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  41.18 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  44.5 
 
 		 297 aa  144  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  39.64 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  40.28 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  37.55 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  39.74 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  43.54 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  43.54 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  43.54 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  39.83 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  43.54 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  43.54 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  43.54 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  39.83 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  43.54 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  40.87 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  42.31 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  40.26 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  39.19 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0840  signal peptidase I  45.32 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00439997  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  40.57 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  37.4 
 
 		 305 aa  138  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  35.02 
 
 		 324 aa  138  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  37.17 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  35.56 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  35.97 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  35.97 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  35.38 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  35.38 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  35.97 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  35.38 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  35.61 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  39.19 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  35.38 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>