More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0949 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  100 
 
 		 249 aa  502  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  73.2 
 
 		 260 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  71.08 
 
 		 260 aa  377  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  71.08 
 
 		 260 aa  377  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  61.13 
 
 		 247 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  59.51 
 
 		 247 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  59.11 
 
 		 247 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  61.76 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  62.3 
 
 		 252 aa  311  4.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  59.02 
 
 		 247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  61.6 
 
 		 252 aa  305  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  60.8 
 
 		 252 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  57.94 
 
 		 259 aa  300  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  62.04 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  61.35 
 
 		 253 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  61.2 
 
 		 252 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  60.4 
 
 		 252 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  58.23 
 
 		 263 aa  288  6e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  57.77 
 
 		 268 aa  288  8e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  61.2 
 
 		 252 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  58.2 
 
 		 245 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  58.51 
 
 		 263 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  56.38 
 
 		 268 aa  262  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  56.38 
 
 		 268 aa  262  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  56.85 
 
 		 271 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  57.32 
 
 		 263 aa  260  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  55.97 
 
 		 268 aa  260  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  52.67 
 
 		 279 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  52.92 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  52.14 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  51.3 
 
 		 263 aa  231  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  50.6 
 
 		 259 aa  228  6e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  49 
 
 		 252 aa  226  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  49.8 
 
 		 261 aa  226  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  48.74 
 
 		 236 aa  224  7e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  47.76 
 
 		 270 aa  221  8e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  46.07 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  50 
 
 		 255 aa  218  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  53 
 
 		 286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  47.13 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  48.52 
 
 		 287 aa  204  9e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  49.07 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  48.46 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  47.21 
 
 		 278 aa  201  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  48.17 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  50 
 
 		 317 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  46.22 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  44.12 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  42.52 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  45.41 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  40.5 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  47.6 
 
 		 288 aa  164  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  49.75 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  38.2 
 
 		 278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  40.84 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  42.23 
 
 		 305 aa  160  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  43.23 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  42.23 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  42.23 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  40.86 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  41.18 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  42.97 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  41.18 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  41.18 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  45.59 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  41.18 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  46.73 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  40.78 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  38.94 
 
 		 245 aa  158  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  41.83 
 
 		 305 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  43.39 
 
 		 305 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  44.98 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  46 
 
 		 262 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  41.18 
 
 		 301 aa  155  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  41.53 
 
 		 299 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  44.75 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  42.74 
 
 		 300 aa  154  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  38.21 
 
 		 325 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  45.23 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  43.54 
 
 		 283 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  40.16 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  42.04 
 
 		 290 aa  152  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  37.73 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  39.83 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  47.24 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  44.22 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  44.72 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  44.72 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  40.09 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  40.52 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  41.78 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  41.78 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  40.81 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  41.6 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  43.54 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  43.32 
 
 		 297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  44.85 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  43.32 
 
 		 297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  39.68 
 
 		 304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  43.32 
 
 		 297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>