More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1808 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  100 
 
 		 287 aa  586  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  59.26 
 
 		 293 aa  317  1e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  47.77 
 
 		 259 aa  228  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  47.81 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  47.97 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  47.97 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  45.32 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  47.97 
 
 		 260 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  47.56 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  43.02 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  45.12 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  43.27 
 
 		 263 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  43.18 
 
 		 252 aa  201  9e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  44.27 
 
 		 247 aa  201  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  42.58 
 
 		 247 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  43.72 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  44.44 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  42.19 
 
 		 247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  44.44 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  43.75 
 
 		 263 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  44.44 
 
 		 268 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  43.72 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  42.91 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  46.84 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  41.13 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  42.15 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  42.7 
 
 		 279 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  40.75 
 
 		 252 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  41.83 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  45.83 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  43.92 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  44.49 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  41.51 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  45.57 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  43.08 
 
 		 271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0909  signal peptidase I  43.97 
 
 		 301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129069  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  44.58 
 
 		 262 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  39.64 
 
 		 263 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  37.29 
 
 		 282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  39.53 
 
 		 260 aa  181  8.000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  40.51 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  42.74 
 
 		 235 aa  175  6e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  41 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  39.61 
 
 		 270 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  40.62 
 
 		 278 aa  165  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  37.12 
 
 		 286 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  40.16 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  40.42 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  37.7 
 
 		 252 aa  155  9e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  39.5 
 
 		 264 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  39.83 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  39.11 
 
 		 256 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  37.92 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  39.22 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  40.97 
 
 		 256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  35.82 
 
 		 263 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  35.82 
 
 		 263 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  37.79 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  36.93 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  35.74 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  34.68 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  36.51 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  38.57 
 
 		 245 aa  132  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  38.46 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  37.5 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  38.16 
 
 		 322 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  33.97 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  38.14 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  38.74 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  37.55 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  35.69 
 
 		 248 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  35.69 
 
 		 248 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  35.8 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  35.52 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  36.46 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  35.96 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  35.51 
 
 		 325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  34.16 
 
 		 299 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  35.82 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  35.54 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  39.21 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  36.23 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  35.71 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  35.71 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  35.71 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  37.7 
 
 		 321 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  38.1 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  36.8 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  36.65 
 
 		 257 aa  126  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  36.2 
 
 		 305 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  36.2 
 
 		 305 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  36.2 
 
 		 305 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  36.2 
 
 		 305 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  37.18 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0373  signal peptidase I  37.74 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.444718  hitchhiker  0.000795915 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  36.23 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  35.15 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  36.26 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  34.23 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  35.66 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>