More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1214 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  100 
 
 		 293 aa  592  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  57.99 
 
 		 287 aa  315  7e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  46.95 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  48.67 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  45.19 
 
 		 259 aa  220  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  46.56 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  45.04 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  44.69 
 
 		 250 aa  212  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  45.42 
 
 		 252 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  45.04 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  45.02 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  47.13 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  46.82 
 
 		 261 aa  209  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  45.8 
 
 		 252 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  45.42 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  43.7 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  43.17 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  44.69 
 
 		 247 aa  204  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  45.96 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  44.28 
 
 		 262 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0909  signal peptidase I  46.24 
 
 		 301 aa  201  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129069  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  42.45 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  43.91 
 
 		 262 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  42.03 
 
 		 268 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  45.31 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  44.53 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  42.91 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  42.91 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  38.68 
 
 		 282 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  45.04 
 
 		 278 aa  192  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  42.53 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  42.37 
 
 		 263 aa  188  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  41.6 
 
 		 236 aa  188  8e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  42.24 
 
 		 263 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  40.59 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  43.37 
 
 		 263 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  43.98 
 
 		 235 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  40 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  40 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  40 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  39.31 
 
 		 278 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  38.28 
 
 		 260 aa  172  7.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  36.84 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  39.71 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  39.09 
 
 		 286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  39.84 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  40.24 
 
 		 252 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  44.6 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  42.62 
 
 		 256 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  37.65 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  40 
 
 		 264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  38.98 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  38.93 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  37.64 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  39.51 
 
 		 297 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  39.51 
 
 		 297 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  39.51 
 
 		 297 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  39.51 
 
 		 297 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  39.09 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  39.09 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  39.09 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  36.84 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  40.08 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  38.22 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  37.55 
 
 		 299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  36.36 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  36 
 
 		 270 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  37.76 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  39.01 
 
 		 322 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  39.5 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  36.63 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  38.57 
 
 		 322 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  37.18 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  36.4 
 
 		 297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  35.98 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  36.4 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0373  signal peptidase I  36.67 
 
 		 381 aa  129  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.444718  hitchhiker  0.000795915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  34.05 
 
 		 305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0331  signal peptidase I  34.94 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  35.48 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  36.49 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  36.48 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  36.48 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0365  peptidase S26A, signal peptidase I  36.76 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  36.9 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  36.61 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  39.13 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  39.13 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  39.13 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  39.13 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  39.13 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  39.13 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  39.13 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  35.52 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  36.57 
 
 		 298 aa  125  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  35.54 
 
 		 266 aa  125  9e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  35.69 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  37.74 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4299  signal peptidase I  37.31 
 
 		 229 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826182 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  34.83 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>