More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0420 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  100 
 
 		 263 aa  541  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  75.77 
 
 		 262 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  75.77 
 
 		 279 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  74.62 
 
 		 262 aa  407  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  68.44 
 
 		 261 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  68.22 
 
 		 259 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  59.06 
 
 		 278 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  51.87 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  52.53 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  51.75 
 
 		 260 aa  235  6e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  51.75 
 
 		 260 aa  235  6e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  51.3 
 
 		 249 aa  231  7.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  51.69 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  47.96 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  47.96 
 
 		 247 aa  222  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  47.58 
 
 		 247 aa  222  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  47.35 
 
 		 245 aa  219  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  49.02 
 
 		 252 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  49.81 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  47.57 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  48.63 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  48.24 
 
 		 252 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  49.41 
 
 		 252 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  49.6 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  48.63 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  44.66 
 
 		 259 aa  206  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  47.22 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  47.15 
 
 		 260 aa  198  7e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  45.31 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  47.66 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  48.44 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  41.5 
 
 		 236 aa  188  1e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  43.07 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  47.2 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  43.23 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  46.09 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  44.3 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  46.89 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  46.81 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  39.64 
 
 		 282 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  44.27 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  44.27 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  43.39 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  44.27 
 
 		 268 aa  175  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  43.04 
 
 		 286 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  42.92 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  41.13 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  44.14 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  40 
 
 		 270 aa  168  8e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  40.62 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  40.67 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  39.41 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  43.93 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0909  signal peptidase I  38.96 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129069  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  41.3 
 
 		 317 aa  148  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  39.26 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  37.85 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  36.12 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  35.02 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  35.02 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  36.67 
 
 		 270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  35.29 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  35.58 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  36.51 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  34.93 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  34.93 
 
 		 332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  36.51 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  39.38 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  36.8 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  34.93 
 
 		 332 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  38.84 
 
 		 267 aa  126  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  38.91 
 
 		 274 aa  125  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  36.6 
 
 		 288 aa  125  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  38.52 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  37.3 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  41.94 
 
 		 322 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  36.68 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  36.29 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  36.68 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  36.68 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  37.2 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  36.68 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  37.99 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  34.82 
 
 		 266 aa  122  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  38.18 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  38.05 
 
 		 262 aa  122  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  38.01 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  34.92 
 
 		 214 aa  122  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  36.36 
 
 		 305 aa  122  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  40.77 
 
 		 305 aa  121  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  37.61 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  36.36 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  35.74 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  36.36 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  35.89 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  35.89 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  35.43 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  36.4 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  34.8 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  32.05 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>