More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0997 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  100 
 
 		 247 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  97.57 
 
 		 247 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  84.21 
 
 		 247 aa  434  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  78.86 
 
 		 247 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  59.11 
 
 		 249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  61.38 
 
 		 260 aa  308  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  62.35 
 
 		 260 aa  308  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  61.38 
 
 		 260 aa  308  4e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  55.79 
 
 		 252 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  56.72 
 
 		 252 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  55.65 
 
 		 253 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  55.79 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  53.6 
 
 		 259 aa  268  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  55.27 
 
 		 260 aa  268  5e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  54.96 
 
 		 252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  53.15 
 
 		 268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  54.55 
 
 		 252 aa  264  8e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  53.72 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  50.97 
 
 		 263 aa  260  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  53.17 
 
 		 263 aa  254  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  52.42 
 
 		 245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  52.7 
 
 		 268 aa  252  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  52.7 
 
 		 268 aa  252  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  55.46 
 
 		 252 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  52.7 
 
 		 268 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  52.38 
 
 		 263 aa  249  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  53.66 
 
 		 271 aa  248  9e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  50.19 
 
 		 279 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  50.19 
 
 		 262 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  50.19 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  47.98 
 
 		 270 aa  228  9e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  48.33 
 
 		 262 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  47.96 
 
 		 263 aa  222  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  46.25 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  45.8 
 
 		 282 aa  221  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  50.44 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  49.78 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  49.06 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  45.42 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  45.83 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  44.13 
 
 		 287 aa  198  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  49.3 
 
 		 235 aa  197  9e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  46.49 
 
 		 252 aa  192  5e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  48.02 
 
 		 248 aa  191  7e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  42.11 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  43.36 
 
 		 264 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  48.6 
 
 		 288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  45.41 
 
 		 317 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  40.57 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  41.53 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  47.14 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  44.59 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  40.93 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  47.47 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  40.93 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  40.93 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  40.93 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  41.04 
 
 		 305 aa  161  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  38.69 
 
 		 305 aa  161  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  42.11 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  43.58 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  39.36 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  45.96 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  39.54 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  39.85 
 
 		 278 aa  158  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  44.7 
 
 		 325 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  37.94 
 
 		 298 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  40.71 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  40.71 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  40.71 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  42.53 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  40.66 
 
 		 199 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  40.25 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  39.6 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  43.84 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  43.84 
 
 		 322 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  38.29 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  39.85 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  41.15 
 
 		 256 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  39.23 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  40.32 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  42.92 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  42.66 
 
 		 324 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  40.08 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  38.76 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  35.55 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  41.27 
 
 		 304 aa  152  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  39.68 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  38.61 
 
 		 299 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  39.6 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  39.84 
 
 		 240 aa  151  7e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  40.42 
 
 		 198 aa  151  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  42.47 
 
 		 325 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  38.02 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  43.89 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  35.82 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  37.1 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  35.82 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  38.26 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  36.04 
 
 		 324 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>