More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1447 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  100 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  84.21 
 
 		 247 aa  434  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  83.81 
 
 		 247 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  77.24 
 
 		 247 aa  401  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  63.07 
 
 		 260 aa  313  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  63.07 
 
 		 260 aa  313  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  63.07 
 
 		 260 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  59.02 
 
 		 249 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  56.33 
 
 		 252 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  55.92 
 
 		 252 aa  279  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  54.88 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  54.69 
 
 		 252 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  58.05 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  56.05 
 
 		 250 aa  274  8e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  54.69 
 
 		 252 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  54.29 
 
 		 252 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  54.18 
 
 		 259 aa  269  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  53.97 
 
 		 268 aa  268  8e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  52.02 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  54.55 
 
 		 245 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  54.29 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  52.5 
 
 		 268 aa  255  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  52.5 
 
 		 268 aa  255  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  52.4 
 
 		 263 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  51.67 
 
 		 268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  52 
 
 		 263 aa  249  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  51.71 
 
 		 279 aa  248  5e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  51.71 
 
 		 262 aa  248  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  51.87 
 
 		 263 aa  247  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  51.67 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  50.95 
 
 		 262 aa  241  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  49.06 
 
 		 261 aa  229  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  47.53 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  48.15 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  48.41 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  48.03 
 
 		 252 aa  221  9e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  44.91 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  44.19 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  46.09 
 
 		 255 aa  205  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  48.1 
 
 		 286 aa  204  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  48.15 
 
 		 235 aa  197  9e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  45.15 
 
 		 287 aa  196  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  46.32 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  44.09 
 
 		 278 aa  191  9e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  46.26 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  46.02 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  42.21 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  44.34 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  46.98 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  41.03 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  39.06 
 
 		 256 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  41.86 
 
 		 305 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  41.86 
 
 		 305 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  41.86 
 
 		 305 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  41.86 
 
 		 305 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  41.96 
 
 		 305 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  41.96 
 
 		 305 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  40.51 
 
 		 299 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  42.48 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  47.74 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  40.38 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  42.8 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  41.57 
 
 		 305 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  46.63 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  44.39 
 
 		 317 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  38.28 
 
 		 290 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  39.43 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0909  signal peptidase I  40.53 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129069  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  41.89 
 
 		 325 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  44.75 
 
 		 325 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  37.45 
 
 		 278 aa  159  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  41.35 
 
 		 297 aa  158  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  41.35 
 
 		 297 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  41.35 
 
 		 297 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  41.35 
 
 		 297 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  40.65 
 
 		 274 aa  158  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  38.33 
 
 		 245 aa  158  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  43.58 
 
 		 325 aa  158  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  39.11 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  41.35 
 
 		 297 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  41.35 
 
 		 297 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  40.51 
 
 		 297 aa  156  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  40.53 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  41.7 
 
 		 322 aa  155  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  41.7 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  36.33 
 
 		 322 aa  155  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  38.75 
 
 		 199 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  39.59 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  39.02 
 
 		 305 aa  155  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  38.55 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  37.82 
 
 		 322 aa  154  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  44.84 
 
 		 283 aa  154  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  39.18 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  40 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  34.89 
 
 		 325 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  41.96 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  43.05 
 
 		 284 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  43.5 
 
 		 284 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  39.37 
 
 		 305 aa  153  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  40.91 
 
 		 305 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>