More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0252 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  100 
 
 		 255 aa  512  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  80.97 
 
 		 256 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  75.78 
 
 		 256 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  76.42 
 
 		 256 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  74.13 
 
 		 264 aa  384  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  51.32 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  46.06 
 
 		 268 aa  206  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  46.09 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  46.43 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  45.87 
 
 		 263 aa  198  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  46.15 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  44.66 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  44.67 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  44.27 
 
 		 260 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  46.15 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  44.03 
 
 		 252 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  41.24 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  46.09 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  42.32 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  47.53 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  42.8 
 
 		 252 aa  188  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  43.25 
 
 		 260 aa  188  9e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  43.25 
 
 		 260 aa  188  9e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  43.19 
 
 		 259 aa  188  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  43.07 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  44.12 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  43.98 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  43.59 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  41.2 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  43.02 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  43.59 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  43.59 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  41.57 
 
 		 262 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  43.35 
 
 		 255 aa  181  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  42.21 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  38.43 
 
 		 247 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  42.44 
 
 		 260 aa  175  6e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  41.58 
 
 		 278 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  40.85 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  42.61 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  40.57 
 
 		 247 aa  168  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  41.15 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  40.57 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  38.55 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  39.39 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  39.84 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  39.53 
 
 		 252 aa  158  9e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  42.79 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  40 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  41.1 
 
 		 293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0909  signal peptidase I  38.87 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129069  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  43.54 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  39.92 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  40.66 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  41.06 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  38.5 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  41.15 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  41.15 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  41.71 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  42.31 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  38.97 
 
 		 267 aa  135  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  39.44 
 
 		 284 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  38.71 
 
 		 299 aa  131  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  39.61 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  39.81 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  36.64 
 
 		 305 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  37.1 
 
 		 299 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  38.57 
 
 		 297 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  38.57 
 
 		 297 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  38.39 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  36.97 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  37.44 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  38.39 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  39.61 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  38.39 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  37.56 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  39.42 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  38.39 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  38.39 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  37.56 
 
 		 284 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  36.49 
 
 		 284 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  37.83 
 
 		 301 aa  125  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  39.23 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  38.81 
 
 		 268 aa  125  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  38.49 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  37.61 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  37.45 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  36.53 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  37.56 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  37.7 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  39.63 
 
 		 255 aa  123  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  37.7 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  37.7 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0839  signal peptidase I  42.71 
 
 		 209 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.240301  normal  0.0615193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  37.7 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  37.62 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  37.09 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  38.89 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  37.16 
 
 		 297 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  37.62 
 
 		 256 aa  123  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>