More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0839 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0839  signal peptidase I  100 
 
 
209 aa  417  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.240301  normal  0.0615193 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  45.1 
 
 
254 aa  148  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  42.71 
 
 
255 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  37.32 
 
 
245 aa  123  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  41.18 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  39.35 
 
 
256 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  41.8 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  40.76 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  40.53 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  37.32 
 
 
287 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  40.32 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  39.13 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  39.67 
 
 
268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  39.67 
 
 
268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  36.24 
 
 
263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  39.67 
 
 
268 aa  112  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  40.11 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  36.32 
 
 
260 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  38.61 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  35.32 
 
 
261 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  38.92 
 
 
245 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  36.28 
 
 
260 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  36.28 
 
 
260 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  38.17 
 
 
250 aa  105  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  35.68 
 
 
236 aa  105  5e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  37.1 
 
 
249 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  38.62 
 
 
253 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  36.84 
 
 
252 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  34.29 
 
 
270 aa  102  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  36.07 
 
 
286 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  35.68 
 
 
235 aa  100  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  34.86 
 
 
259 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  36.41 
 
 
252 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  35.98 
 
 
317 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  34.62 
 
 
290 aa  99.4  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  34.21 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  38.04 
 
 
247 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  37.43 
 
 
247 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  36.36 
 
 
252 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  33.94 
 
 
262 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  35.87 
 
 
252 aa  96.3  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  37.5 
 
 
247 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  33.94 
 
 
279 aa  95.9  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  33.68 
 
 
252 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  33.01 
 
 
259 aa  95.5  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  33.16 
 
 
274 aa  95.5  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0909  signal peptidase I  34.02 
 
 
301 aa  95.5  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129069  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  32.57 
 
 
262 aa  95.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  36.56 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  36.76 
 
 
252 aa  94  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  32.17 
 
 
293 aa  92.8  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  34.67 
 
 
248 aa  91.7  7e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  36.93 
 
 
282 aa  91.7  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  32.62 
 
 
278 aa  91.7  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  28.57 
 
 
252 aa  91.3  8e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  33.91 
 
 
278 aa  90.1  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  34.6 
 
 
255 aa  89.4  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  32.8 
 
 
288 aa  89.4  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  35.14 
 
 
324 aa  88.2  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  34.68 
 
 
321 aa  88.6  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  35.11 
 
 
342 aa  87.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  36.41 
 
 
248 aa  87.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  36.41 
 
 
248 aa  87.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  33.87 
 
 
260 aa  86.7  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  32 
 
 
325 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  37.5 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  32.72 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1540  signal peptidase I  35.18 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  34.81 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  34.34 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  33.82 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  33.15 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2706  signal peptidase I  35.64 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  33.84 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2782  signal peptidase I  35.64 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.310144  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  35.6 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  34.98 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  36.07 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  34.23 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  35.6 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  33.33 
 
 
322 aa  82  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1681  signal peptidase I  36.11 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0422344  normal  0.0473172 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2685  signal peptidase I  34.83 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  32.23 
 
 
288 aa  81.6  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0009  signal peptidase I  30.69 
 
 
230 aa  81.3  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2924  signal peptidase I family protein  35.68 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  33.51 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  32.74 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  33.63 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  32.98 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  32.14 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  34.03 
 
 
284 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1523  signal peptidase I  33.65 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1481  signal peptidase I  34.67 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  34.03 
 
 
284 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  33.33 
 
 
299 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  33.15 
 
 
262 aa  78.2  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  32.3 
 
 
322 aa  78.6  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  31.86 
 
 
322 aa  78.2  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1546  signal peptidase I  34.17 
 
 
220 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0748735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>