More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1523 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1523  signal peptidase I  100 
 
 		 245 aa  500  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1716  putative signal peptidase I (SPase I) protein  49.52 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  50.48 
 
 		 230 aa  201  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  49.52 
 
 		 230 aa  197  9e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1481  signal peptidase I  46.98 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1540  signal peptidase I  46.48 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1546  signal peptidase I  46.51 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1681  signal peptidase I  49.02 
 
 		 220 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0422344  normal  0.0473172 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2782  signal peptidase I  49.02 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.310144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2685  signal peptidase I  49.02 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0576  signal peptidase I  45.89 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2924  signal peptidase I family protein  48.04 
 
 		 220 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2706  signal peptidase I  49.02 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  45.13 
 
 		 219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1665  signal peptidase I  45.49 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.548512  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1727  signal peptidase I  42.74 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  46.83 
 
 		 238 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2510  signal peptidase I  41.88 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266939  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  43.32 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2309  signal peptidase I  42.86 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0009  signal peptidase I  40.09 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  38.57 
 
 		 262 aa  141  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  39.39 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  41.36 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  38.97 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  36.09 
 
 		 321 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  38.42 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  37.04 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1803  signal peptidase I  34.8 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  39.06 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  39.41 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  34.82 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  36.24 
 
 		 305 aa  129  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  36 
 
 		 268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  36.87 
 
 		 322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  36.36 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  35.51 
 
 		 270 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  35.89 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  37.8 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  36.49 
 
 		 300 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  36.57 
 
 		 305 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  36.57 
 
 		 305 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  36.57 
 
 		 305 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1084  signal peptidase I  37.63 
 
 		 297 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  37.63 
 
 		 297 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  33.63 
 
 		 297 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  34.96 
 
 		 297 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  36.57 
 
 		 305 aa  124  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  34.96 
 
 		 297 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0184  signal peptidase I  40.54 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  37.04 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  35.62 
 
 		 324 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  36.73 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  37.04 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  37.04 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  37.04 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  34.51 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  34.67 
 
 		 198 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  34.51 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4299  signal peptidase I  36.04 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826182 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  36.7 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  34.51 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  34.51 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  34.72 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  35.19 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  37.26 
 
 		 301 aa  122  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  34.85 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  34.85 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  36.05 
 
 		 322 aa  122  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  34.18 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  33.04 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  33.47 
 
 		 321 aa  122  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  34.62 
 
 		 200 aa  122  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0840  signal peptidase I  36.6 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00439997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  33.75 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  34.72 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  33.04 
 
 		 297 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  36.05 
 
 		 322 aa  122  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  35.32 
 
 		 256 aa  121  8e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  35.19 
 
 		 305 aa  121  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  33.94 
 
 		 269 aa  121  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  35.32 
 
 		 256 aa  121  8e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  33.78 
 
 		 216 aa  121  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  36.55 
 
 		 257 aa  122  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  33.04 
 
 		 305 aa  121  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  37.31 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  36.05 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  33.95 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  31.3 
 
 		 342 aa  120  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  39.04 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  36.98 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  34.26 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  34.48 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  34.8 
 
 		 322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  36.98 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  34.72 
 
 		 305 aa  119  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  33.94 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  36.73 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  37.19 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  37.19 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>