More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1803 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1803  signal peptidase I  100 
 
 		 253 aa  512  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  35.75 
 
 		 238 aa  138  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1665  signal peptidase I  34.09 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.548512  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0576  signal peptidase I  35.22 
 
 		 232 aa  132  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1681  signal peptidase I  34.56 
 
 		 220 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0422344  normal  0.0473172 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1523  signal peptidase I  34.8 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2685  signal peptidase I  34.56 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2924  signal peptidase I family protein  34.23 
 
 		 220 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2706  signal peptidase I  33.64 
 
 		 220 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1546  signal peptidase I  34.58 
 
 		 220 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1540  signal peptidase I  34.58 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2782  signal peptidase I  33.64 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.310144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1481  signal peptidase I  34.11 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2510  signal peptidase I  32 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266939  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1727  signal peptidase I  32.73 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0009  signal peptidase I  31.94 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2309  signal peptidase I  30.73 
 
 		 216 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  32.08 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  31.34 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  31.8 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  35.47 
 
 		 297 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1716  putative signal peptidase I (SPase I) protein  30.8 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  34.98 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  38.38 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  28.76 
 
 		 219 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  32.75 
 
 		 261 aa  112  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  32.42 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  32.24 
 
 		 322 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  29.44 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  33.33 
 
 		 322 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  33.96 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  33.33 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  32.29 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  34.31 
 
 		 299 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  31.02 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  31.48 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  27.1 
 
 		 217 aa  105  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  32.49 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  31.82 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  30.73 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  30.94 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  31.3 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  31.02 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  31.6 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  33.5 
 
 		 284 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  33.33 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  31.6 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  33.5 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  31.13 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  31.13 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  33.19 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  31.13 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  31.13 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  31.84 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  30.1 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  30.1 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  31.75 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  31.13 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  30.8 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  30.8 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  31.39 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  29.69 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  30.99 
 
 		 321 aa  99.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  28.25 
 
 		 263 aa  99.4  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  31.82 
 
 		 305 aa  99  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  31.77 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  31.77 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  29.54 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  31.77 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  31.77 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  31.77 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  29.91 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  28.37 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  31.77 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  31.77 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  32.29 
 
 		 297 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  31.14 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  31.25 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  33.33 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1084  signal peptidase I  32.29 
 
 		 297 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  29.82 
 
 		 268 aa  96.3  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  30.95 
 
 		 251 aa  95.9  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  30.09 
 
 		 247 aa  95.9  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  30.73 
 
 		 268 aa  95.9  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  31.73 
 
 		 284 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  28.76 
 
 		 199 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  31.08 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  30.56 
 
 		 324 aa  95.5  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  30 
 
 		 305 aa  95.1  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  30.48 
 
 		 251 aa  95.1  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  27.83 
 
 		 256 aa  94.4  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  32.08 
 
 		 325 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  30.24 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  27.83 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  26.82 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  32.24 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  29.54 
 
 		 305 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  29.54 
 
 		 305 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  31.16 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  30.45 
 
 		 305 aa  94  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>