More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1531 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  100 
 
 		 230 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  98.26 
 
 		 230 aa  457  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1716  putative signal peptidase I (SPase I) protein  84.35 
 
 		 230 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1727  signal peptidase I  50.91 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1481  signal peptidase I  46.3 
 
 		 220 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1523  signal peptidase I  50.48 
 
 		 245 aa  201  8e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1540  signal peptidase I  45.83 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1546  signal peptidase I  45.37 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1681  signal peptidase I  46.73 
 
 		 220 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0422344  normal  0.0473172 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  43.17 
 
 		 238 aa  197  9e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2782  signal peptidase I  47.2 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.310144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1665  signal peptidase I  48.52 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.548512  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2510  signal peptidase I  49.09 
 
 		 233 aa  194  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266939  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2706  signal peptidase I  46.73 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2685  signal peptidase I  46.73 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2924  signal peptidase I family protein  45.37 
 
 		 220 aa  189  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0576  signal peptidase I  43.26 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2309  signal peptidase I  42.06 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  37.9 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0009  signal peptidase I  40.85 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  37.44 
 
 		 219 aa  168  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  41.18 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  34.7 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  34.7 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  37.91 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  35.48 
 
 		 256 aa  138  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  38.35 
 
 		 297 aa  134  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  38.35 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  38.35 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  37.38 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  35.65 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  37.38 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  37.38 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  37.38 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  35.27 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  35.82 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  35.82 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  34.26 
 
 		 288 aa  131  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  35.51 
 
 		 263 aa  131  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  40.41 
 
 		 297 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  37.89 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  40.41 
 
 		 297 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  40.41 
 
 		 297 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  40.41 
 
 		 297 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  40.41 
 
 		 297 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  40.41 
 
 		 297 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  40.41 
 
 		 297 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  36 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  36 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  36.56 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  39.9 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  38.07 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  37.44 
 
 		 284 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  36 
 
 		 284 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  36.84 
 
 		 284 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  37.75 
 
 		 279 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  37.75 
 
 		 262 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  34.33 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  37.32 
 
 		 325 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  36 
 
 		 284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  36.4 
 
 		 284 aa  128  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0840  signal peptidase I  38.34 
 
 		 297 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00439997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  37.2 
 
 		 322 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  35.68 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  39.38 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1084  signal peptidase I  38.86 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  37.31 
 
 		 299 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  36.57 
 
 		 305 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  36.04 
 
 		 288 aa  126  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  34.58 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  35.48 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  35.41 
 
 		 342 aa  126  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  35.81 
 
 		 283 aa  125  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  35.21 
 
 		 297 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  36.62 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  34.93 
 
 		 324 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  37.13 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  35.32 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  34.27 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  36.1 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  35.35 
 
 		 300 aa  123  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  36.36 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  34.72 
 
 		 216 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  35.89 
 
 		 322 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  33.63 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  36.45 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  34.65 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  37.5 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  37.31 
 
 		 299 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  35.89 
 
 		 322 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  32.53 
 
 		 322 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  37.5 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  33 
 
 		 255 aa  122  7e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  41.92 
 
 		 268 aa  122  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  35.05 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  34.63 
 
 		 267 aa  121  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  32.14 
 
 		 311 aa  121  9e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  33.64 
 
 		 305 aa  121  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  33.02 
 
 		 305 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  35.75 
 
 		 299 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>