More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0134 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  100 
 
 		 219 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  75.12 
 
 		 217 aa  352  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0576  signal peptidase I  58.93 
 
 		 232 aa  272  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0009  signal peptidase I  55.41 
 
 		 230 aa  269  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1540  signal peptidase I  54.59 
 
 		 220 aa  247  8e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2309  signal peptidase I  53.24 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1546  signal peptidase I  53.67 
 
 		 220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1681  signal peptidase I  54.93 
 
 		 220 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0422344  normal  0.0473172 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2706  signal peptidase I  54.93 
 
 		 220 aa  241  6e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1481  signal peptidase I  54.13 
 
 		 220 aa  241  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2685  signal peptidase I  54.46 
 
 		 220 aa  240  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2782  signal peptidase I  54.46 
 
 		 220 aa  240  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.310144  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2924  signal peptidase I family protein  54.21 
 
 		 220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  51.57 
 
 		 238 aa  227  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1727  signal peptidase I  45.09 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2510  signal peptidase I  45.54 
 
 		 233 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266939  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1665  signal peptidase I  44.93 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.548512  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1523  signal peptidase I  45.13 
 
 		 245 aa  182  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  37.44 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  37.44 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1716  putative signal peptidase I (SPase I) protein  37.44 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  40 
 
 		 255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  39.9 
 
 		 256 aa  141  9e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  40.84 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  38.35 
 
 		 262 aa  135  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  37.39 
 
 		 298 aa  135  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  37 
 
 		 274 aa  135  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  39.5 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  39.09 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  39.09 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  37.56 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  35.22 
 
 		 305 aa  132  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  37 
 
 		 270 aa  131  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  35.65 
 
 		 305 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  39.9 
 
 		 251 aa  131  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  35.65 
 
 		 305 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  35.65 
 
 		 305 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  39.9 
 
 		 251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  37.32 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  35.62 
 
 		 299 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  38.76 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  35.98 
 
 		 322 aa  129  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  35.34 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  35.34 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  35.34 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  35.34 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  35.22 
 
 		 305 aa  128  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0184  signal peptidase I  39.2 
 
 		 208 aa  128  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  35.77 
 
 		 322 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  37.56 
 
 		 288 aa  127  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  36.32 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  34.98 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  36.18 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  38.5 
 
 		 284 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  38.5 
 
 		 284 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  40.11 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  33.75 
 
 		 305 aa  125  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  34.3 
 
 		 305 aa  125  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  33.85 
 
 		 321 aa  125  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  38.5 
 
 		 284 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  35.05 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  39 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  34.11 
 
 		 321 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  33.76 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  35.62 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  35.81 
 
 		 305 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  34.52 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  35.19 
 
 		 301 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  33.91 
 
 		 305 aa  123  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  34.85 
 
 		 216 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  37.25 
 
 		 253 aa  122  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  36.77 
 
 		 299 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  38.5 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  36.36 
 
 		 300 aa  121  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  36.22 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  34.65 
 
 		 304 aa  121  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  35.71 
 
 		 299 aa  121  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  36.25 
 
 		 324 aa  121  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  33.33 
 
 		 332 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  33.73 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  36.68 
 
 		 266 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  35.5 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  37.5 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  37.5 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  33.85 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  35.06 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  34.98 
 
 		 300 aa  119  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  33.78 
 
 		 297 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  33.33 
 
 		 332 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1442  Signal peptidase I  35.86 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  33.33 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  38 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  34.57 
 
 		 199 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  34.11 
 
 		 247 aa  118  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1242  signal peptidase I  38.5 
 
 		 259 aa  118  6e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1201  signal peptidase I  38.5 
 
 		 259 aa  118  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  34.55 
 
 		 305 aa  118  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  32 
 
 		 311 aa  118  6e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  36.02 
 
 		 304 aa  118  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  34.58 
 
 		 247 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>