More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0184 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0184  signal peptidase I  100 
 
 		 208 aa  415  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  40 
 
 		 217 aa  141  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  38.74 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0009  signal peptidase I  34.15 
 
 		 230 aa  134  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1523  signal peptidase I  39.6 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  39.27 
 
 		 263 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2685  signal peptidase I  36.5 
 
 		 220 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0576  signal peptidase I  37.88 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  33.83 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2706  signal peptidase I  35.68 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  34.87 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1540  signal peptidase I  34.36 
 
 		 220 aa  118  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2782  signal peptidase I  35.18 
 
 		 220 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.310144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1681  signal peptidase I  35.68 
 
 		 220 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0422344  normal  0.0473172 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2924  signal peptidase I family protein  35.9 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1481  signal peptidase I  33.85 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1546  signal peptidase I  33.85 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  38.54 
 
 		 230 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1716  putative signal peptidase I (SPase I) protein  39.06 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  34.92 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  35.11 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  32.04 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  32.04 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4299  signal peptidase I  37.62 
 
 		 229 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  33.79 
 
 		 299 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  32.65 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  32 
 
 		 216 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2309  signal peptidase I  34.03 
 
 		 216 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  37.5 
 
 		 230 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  34.69 
 
 		 257 aa  107  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  33.85 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  31.63 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  34.7 
 
 		 299 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  33.17 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  33.16 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  31.88 
 
 		 268 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  31.34 
 
 		 255 aa  105  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4289  signal peptidase I  37.14 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4311  signal peptidase I  37.14 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1665  signal peptidase I  35.27 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.548512  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4158  signal peptidase I  37.14 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  34.45 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2510  signal peptidase I  35.47 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266939  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  32.93 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  31.87 
 
 		 199 aa  105  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  33.97 
 
 		 264 aa  104  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  31.94 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  32.04 
 
 		 288 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  31.09 
 
 		 305 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1727  signal peptidase I  34.98 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  32.37 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  32.37 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  32.41 
 
 		 322 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  31.19 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  29.28 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  31.94 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  34.32 
 
 		 322 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  30.74 
 
 		 305 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  31.65 
 
 		 268 aa  101  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  33.33 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  28.63 
 
 		 301 aa  101  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  32.04 
 
 		 256 aa  101  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  31.37 
 
 		 262 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  29.03 
 
 		 324 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  30.65 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  32.42 
 
 		 297 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  29.15 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  31.2 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  32.42 
 
 		 297 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  31.16 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  36.87 
 
 		 174 aa  99  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  32.77 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  31.03 
 
 		 266 aa  98.6  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  31.91 
 
 		 221 aa  98.2  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  33.18 
 
 		 284 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  34.25 
 
 		 185 aa  98.2  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  33.54 
 
 		 226 aa  98.2  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  34.93 
 
 		 321 aa  98.2  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1201  signal peptidase I  31.91 
 
 		 259 aa  97.8  9e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  31.13 
 
 		 253 aa  97.8  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1242  signal peptidase I  31.91 
 
 		 259 aa  97.8  9e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  30.14 
 
 		 288 aa  97.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  32.42 
 
 		 325 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  28.18 
 
 		 299 aa  97.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  33.94 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  31.94 
 
 		 283 aa  97.1  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  30.67 
 
 		 269 aa  96.7  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  30.88 
 
 		 297 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  30.88 
 
 		 297 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  29.02 
 
 		 299 aa  96.3  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  33.33 
 
 		 216 aa  95.5  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  31.58 
 
 		 262 aa  95.5  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  32.54 
 
 		 247 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  29.96 
 
 		 304 aa  95.5  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  31.6 
 
 		 284 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  30.91 
 
 		 262 aa  94  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  30.43 
 
 		 300 aa  94.4  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  28.57 
 
 		 268 aa  94.4  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  34.39 
 
 		 184 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  33.8 
 
 		 284 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>