More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0662 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  100 
 
 
174 aa  345  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  60.36 
 
 
185 aa  222  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  56.21 
 
 
173 aa  204  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  56.65 
 
 
184 aa  202  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  56.21 
 
 
186 aa  201  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  49.38 
 
 
171 aa  159  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  43.26 
 
 
192 aa  158  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  43.75 
 
 
193 aa  157  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  45.4 
 
 
187 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  44.97 
 
 
197 aa  150  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  43.45 
 
 
190 aa  147  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  42.39 
 
 
216 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  40.64 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  41.24 
 
 
214 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  43.9 
 
 
200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  43.9 
 
 
200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  42.68 
 
 
209 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  41.95 
 
 
193 aa  144  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  40.96 
 
 
199 aa  144  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  42.86 
 
 
221 aa  144  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  42.86 
 
 
220 aa  143  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  43.48 
 
 
221 aa  143  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  48.25 
 
 
170 aa  141  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  40.11 
 
 
198 aa  140  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  41.08 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  42.68 
 
 
198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  41.57 
 
 
199 aa  138  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  39.09 
 
 
256 aa  138  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  45.28 
 
 
173 aa  137  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  42.31 
 
 
219 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  40.66 
 
 
225 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  43.48 
 
 
181 aa  136  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  45.06 
 
 
188 aa  136  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  42.94 
 
 
220 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  38.24 
 
 
248 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  38.24 
 
 
248 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  40.11 
 
 
225 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  41.44 
 
 
214 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  45.14 
 
 
172 aa  132  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  43.29 
 
 
199 aa  132  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  45.34 
 
 
197 aa  132  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  41.18 
 
 
203 aa  130  6.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  43.41 
 
 
222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  39.16 
 
 
190 aa  129  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  38.74 
 
 
267 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  41.88 
 
 
176 aa  128  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  44.65 
 
 
185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  40.43 
 
 
263 aa  128  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  41.99 
 
 
220 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0513  signal peptidase I  47.83 
 
 
216 aa  127  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.124665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  37.56 
 
 
256 aa  127  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  37.56 
 
 
256 aa  127  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  39.9 
 
 
257 aa  127  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  36.1 
 
 
262 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  37.56 
 
 
266 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  42.7 
 
 
206 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  33.18 
 
 
240 aa  125  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1382  signal peptidase I  39.08 
 
 
188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813945  normal  0.891342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  38.07 
 
 
249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  39.67 
 
 
219 aa  124  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  36.28 
 
 
305 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  35.81 
 
 
305 aa  124  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  38.03 
 
 
291 aa  124  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  36.28 
 
 
305 aa  124  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  36.28 
 
 
305 aa  124  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  35.75 
 
 
305 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  37.33 
 
 
283 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  35.75 
 
 
305 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  35.75 
 
 
305 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  35.75 
 
 
305 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2191  peptidase S26A, signal peptidase I  39.26 
 
 
189 aa  123  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  43.04 
 
 
189 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  35.75 
 
 
305 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  40.34 
 
 
183 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  36.1 
 
 
255 aa  122  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  45.7 
 
 
190 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  35.03 
 
 
288 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  39.77 
 
 
183 aa  122  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  42.31 
 
 
226 aa  122  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  34.39 
 
 
305 aa  122  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3523  signal peptidase I  38.07 
 
 
243 aa  121  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  39.29 
 
 
338 aa  121  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  35.35 
 
 
305 aa  121  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  36.7 
 
 
215 aa  120  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  35.14 
 
 
262 aa  120  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  33.81 
 
 
263 aa  120  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  33.81 
 
 
263 aa  120  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  36.62 
 
 
305 aa  120  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  33.94 
 
 
305 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  36.9 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  37.06 
 
 
267 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  35 
 
 
304 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  38.62 
 
 
208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  34.11 
 
 
301 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  34.95 
 
 
216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  37.14 
 
 
301 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2149  signal peptidase I  37.56 
 
 
243 aa  118  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  35.29 
 
 
298 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  34.95 
 
 
215 aa  118  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  36.25 
 
 
173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>