More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2049 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  100 
 
 		 185 aa  373  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  60.36 
 
 		 174 aa  222  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  65.06 
 
 		 186 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  55.56 
 
 		 184 aa  216  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  57.49 
 
 		 173 aa  204  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  47.06 
 
 		 171 aa  160  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  44.57 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  44.38 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  44.57 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  43.09 
 
 		 214 aa  157  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  44.68 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  42.93 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  46.3 
 
 		 187 aa  155  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  46.75 
 
 		 193 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  45.51 
 
 		 198 aa  152  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  41.15 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  41.94 
 
 		 190 aa  151  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  42.05 
 
 		 216 aa  151  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  40 
 
 		 190 aa  149  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  50.34 
 
 		 170 aa  148  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  42.02 
 
 		 221 aa  148  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  40 
 
 		 199 aa  147  8e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  39.61 
 
 		 225 aa  147  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  42.69 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  40.64 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  42.93 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  42.41 
 
 		 219 aa  144  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  39.34 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  40.1 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  35.87 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  41.27 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  42.86 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  42.77 
 
 		 181 aa  141  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  45.64 
 
 		 203 aa  141  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  41.75 
 
 		 222 aa  140  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  43.53 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  42.17 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  44.19 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  41.71 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  42.31 
 
 		 183 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3809  signal peptidase I  50 
 
 		 373 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  42.08 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  39.68 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  36.06 
 
 		 288 aa  137  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  39.9 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  41.85 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  50 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  42.55 
 
 		 226 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  39.39 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  42.94 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  40.11 
 
 		 267 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  42.48 
 
 		 191 aa  133  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  42.08 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  36.81 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  40.76 
 
 		 183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  35.62 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  35.55 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  35.55 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  41.04 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  43.23 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  40.22 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  40.22 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  40.22 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  40.22 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  40.22 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  35 
 
 		 259 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  40.22 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  35.58 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0513  signal peptidase I  45.81 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.124665  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  37.2 
 
 		 274 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  40.22 
 
 		 183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  34.9 
 
 		 256 aa  128  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  41.67 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  36.54 
 
 		 216 aa  127  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  37.88 
 
 		 217 aa  127  8.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  36.76 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  35.75 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  39.67 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  39.67 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  41.32 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  34.02 
 
 		 276 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  39.39 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  35.48 
 
 		 249 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  32.67 
 
 		 279 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  37.44 
 
 		 256 aa  124  7e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  37.44 
 
 		 256 aa  124  7e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  35.51 
 
 		 215 aa  124  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  33.97 
 
 		 255 aa  123  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  35.75 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  32.91 
 
 		 268 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  33.33 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  33.33 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  32.11 
 
 		 252 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  35.75 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3452  signal peptidase I  42.08 
 
 		 349 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  37.31 
 
 		 262 aa  122  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  36.22 
 
 		 266 aa  122  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  32.38 
 
 		 275 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  32.17 
 
 		 305 aa  122  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2652  signal peptidase I  42.08 
 
 		 349 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>