More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2309 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2309  signal peptidase I  100 
 
 		 216 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0576  signal peptidase I  61.16 
 
 		 232 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1540  signal peptidase I  61.01 
 
 		 220 aa  278  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1546  signal peptidase I  61.01 
 
 		 220 aa  275  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2782  signal peptidase I  60.45 
 
 		 220 aa  274  8e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.310144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2706  signal peptidase I  60.45 
 
 		 220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1681  signal peptidase I  60 
 
 		 220 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0422344  normal  0.0473172 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1481  signal peptidase I  60.55 
 
 		 220 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2924  signal peptidase I family protein  60.91 
 
 		 220 aa  270  9e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2685  signal peptidase I  59.55 
 
 		 220 aa  268  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  56.36 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  53.24 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  51.39 
 
 		 217 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0009  signal peptidase I  48.64 
 
 		 230 aa  221  7e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1727  signal peptidase I  47.51 
 
 		 232 aa  211  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2510  signal peptidase I  47.06 
 
 		 233 aa  205  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266939  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1665  signal peptidase I  46.43 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.548512  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  42.06 
 
 		 230 aa  178  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  41.59 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1716  putative signal peptidase I (SPase I) protein  39.56 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1523  signal peptidase I  42.86 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  36.73 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  36.73 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  32.35 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  34.62 
 
 		 274 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  32.18 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1803  signal peptidase I  30.73 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  35.9 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  33.33 
 
 		 288 aa  119  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  34.31 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  35.32 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  32.55 
 
 		 270 aa  117  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  36.32 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  34.48 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  36.06 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  36.32 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  34.45 
 
 		 322 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  35.71 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  33.03 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  33.03 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  36.04 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  34.38 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  33.5 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  35.85 
 
 		 305 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  31.37 
 
 		 256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  33.5 
 
 		 266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  34.67 
 
 		 299 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  35.98 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  35.78 
 
 		 297 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  34.13 
 
 		 322 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  37.36 
 
 		 200 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  31.19 
 
 		 255 aa  112  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  34.53 
 
 		 298 aa  112  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  37.5 
 
 		 284 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  37.56 
 
 		 284 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  37.5 
 
 		 284 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  35.58 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  33.03 
 
 		 297 aa  111  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  33.03 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  33.03 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  35.29 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  33.03 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  33.82 
 
 		 324 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  37.98 
 
 		 284 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  30.34 
 
 		 310 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  34.31 
 
 		 325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  37.98 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  32.58 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  35.89 
 
 		 321 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  30.51 
 
 		 311 aa  110  1.0000000000000001e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  35.1 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  31.82 
 
 		 304 aa  109  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  31.98 
 
 		 299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  34.74 
 
 		 199 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  35.68 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  34.62 
 
 		 342 aa  109  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  35.68 
 
 		 284 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  33.33 
 
 		 283 aa  108  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  33.33 
 
 		 299 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  35.68 
 
 		 284 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  35.68 
 
 		 284 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  33.18 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  34.18 
 
 		 245 aa  108  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  33.83 
 
 		 262 aa  108  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  36.11 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  32.14 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  34.52 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  30.92 
 
 		 263 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  30.92 
 
 		 263 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  31.88 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  31.13 
 
 		 305 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  31.13 
 
 		 305 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  35.42 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  30.13 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  33.03 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  31.13 
 
 		 305 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  31.13 
 
 		 305 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  31.13 
 
 		 305 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  31.28 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  31.13 
 
 		 305 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>