More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1481 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1481  signal peptidase I  100 
 
 		 220 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1540  signal peptidase I  96.82 
 
 		 220 aa  434  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1546  signal peptidase I  96.82 
 
 		 220 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2782  signal peptidase I  85 
 
 		 220 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.310144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2706  signal peptidase I  85 
 
 		 220 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1681  signal peptidase I  84.55 
 
 		 220 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0422344  normal  0.0473172 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2685  signal peptidase I  83.64 
 
 		 220 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2924  signal peptidase I family protein  83.64 
 
 		 220 aa  374  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  65 
 
 		 238 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0576  signal peptidase I  61.19 
 
 		 232 aa  278  4e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2309  signal peptidase I  60.55 
 
 		 216 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  54.13 
 
 		 219 aa  241  6e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0009  signal peptidase I  50.68 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  52.09 
 
 		 217 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1727  signal peptidase I  53.95 
 
 		 232 aa  228  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2510  signal peptidase I  53.95 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266939  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1665  signal peptidase I  51.79 
 
 		 234 aa  215  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.548512  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  46.3 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1716  putative signal peptidase I (SPase I) protein  45.37 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  45.83 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1523  signal peptidase I  46.98 
 
 		 245 aa  189  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  40.61 
 
 		 267 aa  135  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  37.25 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  37.37 
 
 		 199 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  35.85 
 
 		 262 aa  132  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  34.36 
 
 		 305 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  37 
 
 		 263 aa  131  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  34.36 
 
 		 305 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  34.36 
 
 		 305 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  34.36 
 
 		 305 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  36.79 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  36.49 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  33.04 
 
 		 305 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  35.92 
 
 		 198 aa  128  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  33.04 
 
 		 305 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  33.04 
 
 		 305 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  33.04 
 
 		 305 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  34.38 
 
 		 300 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  32.16 
 
 		 305 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  33.63 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  38.89 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  34.8 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  34.8 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1803  signal peptidase I  34.11 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  33.77 
 
 		 305 aa  125  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  34.47 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  34.47 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  37.82 
 
 		 199 aa  125  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  35.71 
 
 		 288 aa  125  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  31.74 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  37.98 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  33.33 
 
 		 305 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  36.14 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  38.1 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  37.44 
 
 		 305 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  36.49 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  34.8 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  35.24 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  31.28 
 
 		 305 aa  122  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  35.47 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  37.62 
 
 		 297 aa  121  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  37.14 
 
 		 297 aa  121  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  36.54 
 
 		 268 aa  121  9e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  32.75 
 
 		 305 aa  121  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  34.62 
 
 		 255 aa  121  9e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  34.69 
 
 		 264 aa  121  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  33.18 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  38.66 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  35.65 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  34.02 
 
 		 256 aa  119  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  34.02 
 
 		 256 aa  119  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  36.08 
 
 		 266 aa  119  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  37.78 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  35.29 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  34.15 
 
 		 251 aa  118  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  34.15 
 
 		 251 aa  117  9e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  36.98 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  35.68 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  33.19 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  37.82 
 
 		 225 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  38.53 
 
 		 299 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  30.77 
 
 		 301 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  35.29 
 
 		 274 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  35.21 
 
 		 284 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  35.16 
 
 		 299 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  34.76 
 
 		 270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  33.62 
 
 		 261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  38.69 
 
 		 253 aa  114  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  36.27 
 
 		 225 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  34.6 
 
 		 300 aa  114  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  31.23 
 
 		 321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1373  signal peptidase I  35.6 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1442  Signal peptidase I  35.6 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  38.03 
 
 		 262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  35 
 
 		 283 aa  113  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  36.95 
 
 		 322 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  30.83 
 
 		 321 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  37.22 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  30.6 
 
 		 311 aa  112  3e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  34.98 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>