More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1540 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1540  signal peptidase I  100 
 
 		 220 aa  447  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1481  signal peptidase I  96.82 
 
 		 220 aa  434  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1546  signal peptidase I  96.36 
 
 		 220 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1681  signal peptidase I  85 
 
 		 220 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0422344  normal  0.0473172 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2782  signal peptidase I  85.45 
 
 		 220 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.310144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2706  signal peptidase I  85.45 
 
 		 220 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2685  signal peptidase I  84.09 
 
 		 220 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2924  signal peptidase I family protein  84.09 
 
 		 220 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  64.55 
 
 		 238 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0576  signal peptidase I  61.43 
 
 		 232 aa  285  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2309  signal peptidase I  61.01 
 
 		 216 aa  278  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  54.59 
 
 		 219 aa  247  9e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  53.02 
 
 		 217 aa  237  8e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0009  signal peptidase I  50.68 
 
 		 230 aa  236  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1727  signal peptidase I  54.42 
 
 		 232 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2510  signal peptidase I  54.42 
 
 		 233 aa  228  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266939  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1665  signal peptidase I  50.89 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.548512  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  45.83 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1716  putative signal peptidase I (SPase I) protein  47.25 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  45.37 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1523  signal peptidase I  46.48 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  38.24 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  41.12 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  38.89 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  36.71 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  33.92 
 
 		 305 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  33.92 
 
 		 305 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  33.92 
 
 		 305 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  33.92 
 
 		 305 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  36.79 
 
 		 288 aa  130  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  37 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  33.48 
 
 		 305 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  33.04 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  36.14 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  33.04 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  33.04 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  39.39 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  36.65 
 
 		 199 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  36.18 
 
 		 248 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  36.18 
 
 		 248 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  34.82 
 
 		 304 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  36.24 
 
 		 305 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1803  signal peptidase I  34.58 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  32.6 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  37.04 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  38.12 
 
 		 200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  39.71 
 
 		 268 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  38.46 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  34.95 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  34.95 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  36.22 
 
 		 288 aa  126  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  36.22 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  34.38 
 
 		 300 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  34.67 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  37.02 
 
 		 268 aa  124  8.000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  35.05 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  35.29 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  35.05 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  37.81 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  38.1 
 
 		 297 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  32.02 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  34.22 
 
 		 305 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  36.84 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  37.62 
 
 		 297 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  36.52 
 
 		 298 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  39.18 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  32.33 
 
 		 305 aa  121  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  38.33 
 
 		 222 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  31.42 
 
 		 305 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  35 
 
 		 251 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  35 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  35.96 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  36.32 
 
 		 274 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  35.78 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  34.31 
 
 		 267 aa  118  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  31.22 
 
 		 301 aa  118  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  37.93 
 
 		 322 aa  118  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  34.42 
 
 		 299 aa  118  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  38.34 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  32.74 
 
 		 304 aa  118  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  35.75 
 
 		 299 aa  118  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  33.82 
 
 		 270 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  36.71 
 
 		 284 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  36.79 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  38.18 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  35.57 
 
 		 266 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  39.2 
 
 		 253 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  38.5 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1373  signal peptidase I  36.13 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1442  Signal peptidase I  36.13 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  33.19 
 
 		 301 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  36.23 
 
 		 284 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  33.48 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  35.43 
 
 		 269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  37.78 
 
 		 226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  34.7 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0184  signal peptidase I  36.16 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  35.98 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2196  signal peptidase I  35.8 
 
 		 340 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  31.23 
 
 		 321 aa  113  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>