More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0576 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0576  signal peptidase I  100 
 
 		 232 aa  472  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1540  signal peptidase I  61.43 
 
 		 220 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2309  signal peptidase I  61.16 
 
 		 216 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2782  signal peptidase I  60.91 
 
 		 220 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.310144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2706  signal peptidase I  60.91 
 
 		 220 aa  278  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1681  signal peptidase I  60.73 
 
 		 220 aa  278  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0422344  normal  0.0473172 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1481  signal peptidase I  61.19 
 
 		 220 aa  278  5e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2685  signal peptidase I  60.45 
 
 		 220 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1546  signal peptidase I  60.09 
 
 		 220 aa  277  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2924  signal peptidase I family protein  61.75 
 
 		 220 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  58.93 
 
 		 219 aa  272  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  54.67 
 
 		 217 aa  259  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  58.82 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0009  signal peptidase I  50.44 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1727  signal peptidase I  52.51 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2510  signal peptidase I  51.79 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266939  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1665  signal peptidase I  50 
 
 		 234 aa  218  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.548512  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  43.26 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  43.26 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1523  signal peptidase I  45.89 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1716  putative signal peptidase I (SPase I) protein  42.67 
 
 		 230 aa  181  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  36.14 
 
 		 262 aa  136  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  39.7 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  37.62 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  37.93 
 
 		 288 aa  133  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1803  signal peptidase I  35.22 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  35.74 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  36.09 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  36.54 
 
 		 288 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  37.86 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  37.86 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  36.65 
 
 		 268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  37.44 
 
 		 266 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  36.82 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  38.6 
 
 		 283 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  36.5 
 
 		 256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  36.5 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  36.63 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  37 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  35.98 
 
 		 284 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  36.36 
 
 		 305 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  33.89 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  34.27 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  35.98 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1373  signal peptidase I  35.44 
 
 		 264 aa  123  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1442  Signal peptidase I  35.44 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  34.53 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  35.98 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  35.71 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  35.22 
 
 		 247 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  34.75 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  34.75 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  36.28 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  35.1 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  34.6 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  34.6 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  34.6 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  35.02 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  34.6 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  36.5 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  35.59 
 
 		 262 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  36.74 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  34.7 
 
 		 284 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  34.51 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  34.45 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  34.09 
 
 		 247 aa  118  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  30.34 
 
 		 268 aa  118  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  34.12 
 
 		 300 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  34.38 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  36.54 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  33.79 
 
 		 304 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  36.23 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  35 
 
 		 325 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  36.11 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  36.11 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  33.81 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  34.89 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  33.03 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  32.57 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  33.03 
 
 		 297 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  31.98 
 
 		 305 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  31.98 
 
 		 305 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  32.57 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  35.2 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  33.79 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  35.68 
 
 		 322 aa  116  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  31.22 
 
 		 305 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  31.47 
 
 		 324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  32.55 
 
 		 305 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  32.09 
 
 		 270 aa  115  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  32.55 
 
 		 305 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  32.55 
 
 		 305 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  32.55 
 
 		 305 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  36.56 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  33.93 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  33.93 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  32.74 
 
 		 305 aa  115  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  32.42 
 
 		 305 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  33.73 
 
 		 332 aa  115  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  33.02 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>