More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1716 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1716  putative signal peptidase I (SPase I) protein  100 
 
 		 230 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  84.78 
 
 		 230 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  84.35 
 
 		 230 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1727  signal peptidase I  50.22 
 
 		 232 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1523  signal peptidase I  49.52 
 
 		 245 aa  203  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1481  signal peptidase I  45.37 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2510  signal peptidase I  48.05 
 
 		 233 aa  197  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266939  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1540  signal peptidase I  47.25 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1665  signal peptidase I  49.15 
 
 		 234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.548512  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1546  signal peptidase I  46.79 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  44.14 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1681  signal peptidase I  47.03 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0422344  normal  0.0473172 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2782  signal peptidase I  46.58 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.310144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2706  signal peptidase I  46.12 
 
 		 220 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2685  signal peptidase I  46.58 
 
 		 220 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2924  signal peptidase I family protein  45.33 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0576  signal peptidase I  42.67 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2309  signal peptidase I  39.56 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0009  signal peptidase I  41.18 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  38.14 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  37.44 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  39.45 
 
 		 263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  39.45 
 
 		 263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  37.44 
 
 		 274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  37.37 
 
 		 262 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  35.91 
 
 		 270 aa  132  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  38.05 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  36.24 
 
 		 263 aa  131  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  39.32 
 
 		 297 aa  131  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  37.14 
 
 		 305 aa  131  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  39.32 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  39.32 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  37.21 
 
 		 305 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  39.32 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  37.09 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  35.78 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  35.21 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  35.21 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  35.21 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  35.21 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  37 
 
 		 267 aa  128  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  36.19 
 
 		 305 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  38.35 
 
 		 297 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1373  signal peptidase I  37.38 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  36.07 
 
 		 305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  33.58 
 
 		 322 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  40.31 
 
 		 322 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  37.69 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  34.91 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1442  Signal peptidase I  37.38 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  35.89 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  34.91 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  34.91 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  34.91 
 
 		 305 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  36.36 
 
 		 279 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  35.68 
 
 		 304 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  36.36 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  37.72 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  37.72 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  37.86 
 
 		 297 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  35.85 
 
 		 305 aa  125  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  37.86 
 
 		 297 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  37.21 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  37.21 
 
 		 266 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  36.36 
 
 		 325 aa  124  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  36.12 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  35.15 
 
 		 266 aa  123  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  36.44 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  35.78 
 
 		 248 aa  123  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  35.78 
 
 		 248 aa  123  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  33.86 
 
 		 311 aa  123  2e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  37.07 
 
 		 283 aa  123  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  36 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  37.56 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  36.12 
 
 		 284 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  34.68 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  35.35 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  40.1 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  36.44 
 
 		 284 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  36.44 
 
 		 284 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  36.04 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  35.75 
 
 		 269 aa  121  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  38.31 
 
 		 299 aa  121  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  34.91 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  34.73 
 
 		 284 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  35.85 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  36.63 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  34.01 
 
 		 199 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  37.61 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  36.82 
 
 		 262 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  37.69 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  34.56 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  36.62 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  37.68 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  34.91 
 
 		 310 aa  119  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  40.43 
 
 		 297 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0840  signal peptidase I  37.86 
 
 		 297 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00439997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  40.43 
 
 		 297 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  40.43 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  40.43 
 
 		 297 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>