More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1665 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1665  signal peptidase I  100 
 
 		 234 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.548512  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1727  signal peptidase I  80.6 
 
 		 232 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2510  signal peptidase I  80.6 
 
 		 233 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266939  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  54.42 
 
 		 238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2685  signal peptidase I  53.78 
 
 		 220 aa  228  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2924  signal peptidase I family protein  53.78 
 
 		 220 aa  228  7e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2782  signal peptidase I  53.78 
 
 		 220 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.310144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1681  signal peptidase I  53.78 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0422344  normal  0.0473172 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2706  signal peptidase I  53.33 
 
 		 220 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1540  signal peptidase I  50.89 
 
 		 220 aa  219  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0576  signal peptidase I  50 
 
 		 232 aa  218  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1481  signal peptidase I  51.79 
 
 		 220 aa  215  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1546  signal peptidase I  51.12 
 
 		 220 aa  214  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  44.93 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  44.64 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2309  signal peptidase I  46.43 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1716  putative signal peptidase I (SPase I) protein  49.15 
 
 		 230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  48.52 
 
 		 230 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  48.1 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0009  signal peptidase I  45.28 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1523  signal peptidase I  45.49 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1803  signal peptidase I  34.09 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  38.81 
 
 		 274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  36.36 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  35.71 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  34.1 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  35.94 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  38.05 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  34.93 
 
 		 216 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  35.48 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  33.96 
 
 		 198 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  33.48 
 
 		 240 aa  121  8e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  34.38 
 
 		 305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  34.36 
 
 		 221 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  34.68 
 
 		 299 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  34.4 
 
 		 216 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  34.91 
 
 		 284 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  32.19 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  32.19 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  34.8 
 
 		 248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  34.8 
 
 		 248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  38.25 
 
 		 257 aa  114  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  34.48 
 
 		 284 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  34.38 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  31.63 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  38.68 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  36.49 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  38.68 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  34.08 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  31.15 
 
 		 305 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  30.56 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  32.51 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  37.26 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  33.62 
 
 		 284 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  36.79 
 
 		 297 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  32.51 
 
 		 299 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  32.67 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  30.42 
 
 		 305 aa  112  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  31.16 
 
 		 322 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  36.79 
 
 		 297 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  30.77 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  32.67 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  36.79 
 
 		 297 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  36.79 
 
 		 297 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  34.34 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  33.18 
 
 		 270 aa  111  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  33.78 
 
 		 268 aa  111  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  35.75 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  35.79 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  33.5 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  33.98 
 
 		 267 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  29.8 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  32.76 
 
 		 284 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  32.76 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  36.79 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  32.83 
 
 		 200 aa  109  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0840  signal peptidase I  37.84 
 
 		 297 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00439997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  32.76 
 
 		 284 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  31.42 
 
 		 219 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1084  signal peptidase I  37.5 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  35.27 
 
 		 322 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  39.06 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  39.06 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  39.06 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  39.06 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  33.48 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  39.06 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  39.06 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  39.06 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  37.5 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  30.2 
 
 		 305 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  31.9 
 
 		 284 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  32.71 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  32.35 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  34.03 
 
 		 288 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  32.63 
 
 		 301 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  31.28 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  31.89 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  31.89 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  31.89 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>