More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0487 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  100 
 
 		 220 aa  449  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  65.75 
 
 		 200 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  65.75 
 
 		 200 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  66.47 
 
 		 214 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  50.93 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  50.24 
 
 		 216 aa  217  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  52.79 
 
 		 197 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  52.88 
 
 		 215 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  51.17 
 
 		 217 aa  206  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  54.5 
 
 		 190 aa  203  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  50.53 
 
 		 192 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  50.51 
 
 		 198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  53.76 
 
 		 193 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  50.53 
 
 		 190 aa  191  8e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  52.6 
 
 		 209 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  53.55 
 
 		 203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  50.6 
 
 		 173 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  45.98 
 
 		 181 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  42.86 
 
 		 186 aa  161  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  46.6 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  46.6 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06621  leader peptidase I  46.2 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.929387  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06321  leader peptidase I  46.2 
 
 		 194 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0606  leader peptidase I  48.09 
 
 		 194 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  45.18 
 
 		 199 aa  156  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  47.06 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  43.35 
 
 		 187 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  48.43 
 
 		 189 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  47.02 
 
 		 171 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1121  thylakoidal processing peptidase  50 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0767152  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  38.67 
 
 		 231 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  45.03 
 
 		 173 aa  149  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10441  leader peptidase I  46.63 
 
 		 196 aa  148  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  43.81 
 
 		 200 aa  148  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06711  leader peptidase I  49.4 
 
 		 194 aa  148  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  39.56 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  42.94 
 
 		 185 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  44.91 
 
 		 176 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  43.52 
 
 		 199 aa  145  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  43.2 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  42.86 
 
 		 174 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  39.9 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07511  Signal peptidase I  40.71 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9241  predicted protein  40.46 
 
 		 178 aa  142  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  41.24 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  44.31 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05401  Signal peptidase I  39.9 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05151  Signal peptidase I  38.5 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.715932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0514  Signal peptidase I  38.79 
 
 		 219 aa  138  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.299023  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  42.71 
 
 		 198 aa  138  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05771  Signal peptidase I  43.46 
 
 		 211 aa  137  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  41.58 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  42.94 
 
 		 173 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18791  leader peptidase I  44.31 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  43.27 
 
 		 184 aa  135  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  37.5 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  40.1 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  39.63 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05701  Signal peptidase I  40.29 
 
 		 219 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  40.84 
 
 		 225 aa  134  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  41.88 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3452  signal peptidase I  50 
 
 		 349 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  43.07 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2652  signal peptidase I  50 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  41.29 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  41.03 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  41.5 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  38.54 
 
 		 216 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  38.92 
 
 		 193 aa  132  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3809  signal peptidase I  40.72 
 
 		 373 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  45.45 
 
 		 172 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  42.42 
 
 		 226 aa  128  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  40.91 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  41.4 
 
 		 184 aa  127  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  40.34 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  41.24 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  36.12 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  39.15 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  38 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  39.01 
 
 		 183 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  35.57 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  38.29 
 
 		 183 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  38.29 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  38.29 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  38.29 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  38.29 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  38.86 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  38.86 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  38.29 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  38.29 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  37.43 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  37.16 
 
 		 184 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  42.18 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1183  signal peptidase I  34.1 
 
 		 193 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  36.56 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  35.59 
 
 		 360 aa  116  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  43.95 
 
 		 191 aa  116  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  36.02 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  37.13 
 
 		 434 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  34.47 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>