More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1119 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  100 
 
 		 240 aa  481  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  45.69 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  45.26 
 
 		 225 aa  174  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  41.99 
 
 		 262 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  42.74 
 
 		 216 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  36.67 
 
 		 263 aa  170  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  36.67 
 
 		 263 aa  170  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  40.43 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  44.72 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  44.72 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  42.36 
 
 		 221 aa  168  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  44.83 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  40.26 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  37.82 
 
 		 257 aa  165  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  40.68 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  41.98 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  41.98 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  41.86 
 
 		 266 aa  162  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  38.96 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  39.72 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  39.74 
 
 		 288 aa  162  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  38.53 
 
 		 216 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  42.24 
 
 		 226 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  38.53 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  38.2 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  39.18 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  39.18 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  39.6 
 
 		 247 aa  158  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  40.56 
 
 		 221 aa  158  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  41.67 
 
 		 214 aa  158  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  39.11 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  39.18 
 
 		 297 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  39.18 
 
 		 297 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  39.18 
 
 		 297 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  40.42 
 
 		 297 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  38.78 
 
 		 297 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  39.75 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  40.54 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  38.14 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  38.14 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  40.66 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  34.73 
 
 		 267 aa  154  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  39.84 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  39.84 
 
 		 247 aa  151  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  36.9 
 
 		 269 aa  151  8.999999999999999e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  41.25 
 
 		 299 aa  151  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  40.81 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  35.69 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  45.31 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  40.17 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  40.09 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  36.99 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  39.83 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  38.53 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  38.11 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  38.7 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  39.13 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  41.4 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  37.76 
 
 		 263 aa  148  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  38.03 
 
 		 274 aa  148  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  37.83 
 
 		 252 aa  148  8e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  37.34 
 
 		 263 aa  148  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  37.5 
 
 		 300 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  41.74 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  41.89 
 
 		 297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  41.44 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  38.37 
 
 		 250 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  35.64 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  40.35 
 
 		 305 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  38.7 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  38.7 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  32.85 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  41.63 
 
 		 297 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  40.54 
 
 		 325 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  40.83 
 
 		 268 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  37.83 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  41.63 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  41.63 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  41.63 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  41.63 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  41.63 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  41.63 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  41.63 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  39.3 
 
 		 252 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  36.47 
 
 		 271 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  38.33 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  36.96 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  37.86 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  37.08 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  36.82 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  40.76 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  36.86 
 
 		 305 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  35.87 
 
 		 185 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  37.55 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  37.39 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  35.86 
 
 		 283 aa  142  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  36.72 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  36.4 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  39.35 
 
 		 322 aa  142  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  38.89 
 
 		 321 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>