More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2628 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  100 
 
 
260 aa  525  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  93.46 
 
 
260 aa  497  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  93.46 
 
 
260 aa  497  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  73.2 
 
 
249 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  66.95 
 
 
260 aa  344  8e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  61.69 
 
 
247 aa  317  9e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  63.16 
 
 
252 aa  316  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  61.6 
 
 
250 aa  315  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  63.07 
 
 
247 aa  312  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  62.1 
 
 
247 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  62.35 
 
 
247 aa  308  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  60.16 
 
 
252 aa  307  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  60.08 
 
 
252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  60.16 
 
 
252 aa  306  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  59.76 
 
 
252 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  59.92 
 
 
253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  60 
 
 
268 aa  297  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  60.87 
 
 
252 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  57.49 
 
 
259 aa  286  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  58 
 
 
268 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  58 
 
 
268 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  55.95 
 
 
263 aa  285  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  57.6 
 
 
268 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  57.2 
 
 
271 aa  276  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  59.58 
 
 
263 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  58.26 
 
 
263 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  54.96 
 
 
245 aa  266  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  53.18 
 
 
262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  52.94 
 
 
279 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  53.18 
 
 
262 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  52.53 
 
 
263 aa  236  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  49.03 
 
 
270 aa  234  7e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  45.88 
 
 
282 aa  229  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  48.21 
 
 
252 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  46.5 
 
 
236 aa  221  7e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  48.63 
 
 
259 aa  219  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  47.15 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  48.54 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  49.75 
 
 
286 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  48.95 
 
 
287 aa  206  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  45.88 
 
 
278 aa  201  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  49.34 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  47.22 
 
 
235 aa  201  9.999999999999999e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  44.27 
 
 
255 aa  192  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  52.43 
 
 
317 aa  189  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  42.53 
 
 
293 aa  188  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  45.91 
 
 
264 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  44.1 
 
 
252 aa  181  7e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  42.39 
 
 
256 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  45.29 
 
 
256 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  41.04 
 
 
278 aa  169  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  40.23 
 
 
256 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  40.67 
 
 
301 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  40.67 
 
 
305 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  40.78 
 
 
290 aa  158  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  38.58 
 
 
305 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  48.04 
 
 
256 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  38.66 
 
 
305 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  40.22 
 
 
321 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  38.66 
 
 
305 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  38.66 
 
 
305 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  38.66 
 
 
305 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  39.24 
 
 
321 aa  155  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  46.41 
 
 
267 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  40.66 
 
 
240 aa  155  8e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  38.35 
 
 
305 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  41.04 
 
 
305 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  42.79 
 
 
245 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  41.04 
 
 
305 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  41.04 
 
 
305 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  39.71 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  42.23 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  37.92 
 
 
305 aa  152  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  42.62 
 
 
274 aa  152  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  39.2 
 
 
310 aa  152  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  37.94 
 
 
325 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  44.71 
 
 
248 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  44.71 
 
 
248 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  42.01 
 
 
262 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  37.36 
 
 
305 aa  149  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  42.86 
 
 
288 aa  149  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  40.76 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  37.68 
 
 
322 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  37.6 
 
 
301 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  41.63 
 
 
299 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  45 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  40.8 
 
 
300 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  40.94 
 
 
304 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  36.98 
 
 
304 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  35.42 
 
 
332 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  41.26 
 
 
255 aa  143  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  40.18 
 
 
263 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  35.42 
 
 
332 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  35.42 
 
 
332 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  40.18 
 
 
263 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  44.95 
 
 
266 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  39.83 
 
 
270 aa  143  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  44.22 
 
 
263 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  36.04 
 
 
324 aa  142  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  43.54 
 
 
284 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>