More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2871 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  100 
 
 		 245 aa  486  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  51.32 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  52.25 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  48.18 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  48.47 
 
 		 256 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  48.65 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  41.57 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  42.92 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  42.54 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  43.56 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  41.08 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  41.08 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  41.91 
 
 		 262 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  42.29 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  40.76 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  39.04 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  41.1 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  38.94 
 
 		 249 aa  158  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  40.97 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  40.97 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  40.25 
 
 		 252 aa  158  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  38.33 
 
 		 247 aa  158  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  40.08 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  40.68 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  38.89 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  40.35 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  40.35 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  39.21 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  42.45 
 
 		 255 aa  154  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  40.35 
 
 		 268 aa  154  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  39.32 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  40.35 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  42.79 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  40.34 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  38.56 
 
 		 252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  38.98 
 
 		 252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  39.22 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  38.26 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  40 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  39.9 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  36.4 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  40.89 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  38.19 
 
 		 290 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  35.8 
 
 		 278 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  37.78 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  36.52 
 
 		 270 aa  139  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  34.1 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  38 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  40 
 
 		 286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  36.73 
 
 		 252 aa  135  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  38.91 
 
 		 287 aa  131  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  34.26 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0909  signal peptidase I  34.07 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129069  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  38.34 
 
 		 317 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0839  signal peptidase I  37.32 
 
 		 209 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.240301  normal  0.0615193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  39.41 
 
 		 262 aa  122  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  38.81 
 
 		 254 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  35.92 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  35.71 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  35.81 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  38.14 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  36.24 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  34.43 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  34.43 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  37.75 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  38.14 
 
 		 217 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0576  signal peptidase I  35.29 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  35.07 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  32.75 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  34.11 
 
 		 298 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  37.2 
 
 		 284 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  37.56 
 
 		 284 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  32.75 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  32.75 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  32.75 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  32.75 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  36.67 
 
 		 251 aa  111  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  36.19 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  33.64 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  34.23 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  38.54 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  36.61 
 
 		 305 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  36.61 
 
 		 305 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  37.8 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  38.42 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  32.75 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  37.09 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  32.75 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  36.61 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  33.94 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  33.94 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  33.94 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  33.92 
 
 		 322 aa  109  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  33.94 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  33.94 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  33.94 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  33.94 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  35.27 
 
 		 305 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  33.94 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  35.27 
 
 		 305 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>