More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2252 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  100 
 
 		 252 aa  518  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  93.65 
 
 		 252 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  88.89 
 
 		 252 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  87.7 
 
 		 252 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  86.9 
 
 		 252 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  86.17 
 
 		 253 aa  457  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  87.3 
 
 		 252 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  74.21 
 
 		 250 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  60.96 
 
 		 259 aa  330  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  64.08 
 
 		 260 aa  323  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  64.08 
 
 		 260 aa  323  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  62.7 
 
 		 268 aa  322  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  62.7 
 
 		 268 aa  322  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  62.3 
 
 		 268 aa  319  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  62 
 
 		 271 aa  317  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  63.16 
 
 		 260 aa  316  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  62.3 
 
 		 249 aa  311  4.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  61.66 
 
 		 268 aa  311  6.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  62.66 
 
 		 263 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  60.39 
 
 		 263 aa  308  5e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  62.3 
 
 		 263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  58.26 
 
 		 245 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  56.33 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  57.02 
 
 		 260 aa  278  5e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  54.55 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  56.72 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  55.88 
 
 		 247 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  51.6 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  53.78 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  52.4 
 
 		 252 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  48.89 
 
 		 279 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  48.88 
 
 		 262 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  48.89 
 
 		 262 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  46.59 
 
 		 282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  46.95 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  48.08 
 
 		 259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  52.11 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  46.21 
 
 		 261 aa  216  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  48.63 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  48.47 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  45.94 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  46.98 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  46.41 
 
 		 287 aa  202  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  44.27 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  47.56 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  42.8 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  47.55 
 
 		 286 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  44.39 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  43.8 
 
 		 256 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  44.96 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  45.95 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  40.67 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  40.64 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  40.25 
 
 		 245 aa  158  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  42.48 
 
 		 299 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  41.95 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  39.82 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  42.08 
 
 		 297 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  39.53 
 
 		 305 aa  149  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  43.56 
 
 		 266 aa  149  6e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  41.63 
 
 		 297 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  41.63 
 
 		 297 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  41.63 
 
 		 297 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  42.99 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  45.27 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  40.72 
 
 		 297 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  38.67 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  41.18 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  41.18 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  39.83 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  39.83 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  41.71 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  40.09 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  36.96 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  37.92 
 
 		 298 aa  143  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  43.78 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  42.86 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  42.86 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  39.55 
 
 		 322 aa  142  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  40.45 
 
 		 254 aa  141  9e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  37.45 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  43.84 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  37.79 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  42.99 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  35.02 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  40.91 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  39.45 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  37.84 
 
 		 305 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  35.64 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  35.99 
 
 		 321 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0909  signal peptidase I  37.02 
 
 		 301 aa  139  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129069  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  36.13 
 
 		 322 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  38.02 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  39.27 
 
 		 325 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  38.99 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  40.39 
 
 		 267 aa  138  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  35.77 
 
 		 342 aa  138  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  35.64 
 
 		 324 aa  138  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  36.47 
 
 		 305 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  36.47 
 
 		 305 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>