More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2598 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  100 
 
 		 317 aa  639    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  44.25 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  52.91 
 
 		 260 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  52.91 
 
 		 260 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  50 
 
 		 249 aa  189  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  52.43 
 
 		 260 aa  189  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  46.38 
 
 		 247 aa  180  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  45.78 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  46.01 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  47.06 
 
 		 253 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  45.89 
 
 		 247 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  45.95 
 
 		 252 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  45.41 
 
 		 247 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  45.05 
 
 		 252 aa  168  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  44.64 
 
 		 263 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  45.95 
 
 		 252 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  44.19 
 
 		 245 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  45.45 
 
 		 252 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  48.78 
 
 		 252 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  43.58 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  43.58 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  43.58 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  45.05 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  44.39 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  44.19 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  44.5 
 
 		 250 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  44.7 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  42.5 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  40.35 
 
 		 270 aa  155  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  43.67 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  43.67 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  42.79 
 
 		 262 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  40.38 
 
 		 236 aa  152  8e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  42.06 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  41.3 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  40.17 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  38.43 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  38.5 
 
 		 255 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  38.22 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  42.93 
 
 		 235 aa  132  6e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  38.21 
 
 		 278 aa  132  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  41.05 
 
 		 264 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  40.09 
 
 		 248 aa  132  7.999999999999999e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  40.59 
 
 		 284 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  40.1 
 
 		 284 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  36.71 
 
 		 282 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  40.38 
 
 		 252 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  38.97 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  36.91 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  36.84 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  37.23 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  40.1 
 
 		 284 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  40 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  39.6 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  36.49 
 
 		 256 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  36.24 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  40.67 
 
 		 284 aa  126  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  39.5 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  39.5 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  38.25 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  38.34 
 
 		 245 aa  123  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  40.76 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  39.7 
 
 		 288 aa  123  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  37.31 
 
 		 267 aa  123  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  36.94 
 
 		 257 aa  122  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  33.18 
 
 		 267 aa  122  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  39.6 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  39.11 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  39.39 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  39.39 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  37.62 
 
 		 284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  35.5 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  38.14 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  35.93 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  38.61 
 
 		 284 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  34.67 
 
 		 266 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  37.04 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  33.74 
 
 		 293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  34.6 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  34.76 
 
 		 266 aa  116  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  35.68 
 
 		 305 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  35.45 
 
 		 322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  36.04 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  36.73 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  34.02 
 
 		 297 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  32.96 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  34.02 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  38.39 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  33.94 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  34.31 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  32.06 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  35.24 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  36.06 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  36.06 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  36.06 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  34.36 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  37.02 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  37.02 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  36.06 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  36.36 
 
 		 253 aa  113  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>