More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2442 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  100 
 
 		 268 aa  549  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  78.65 
 
 		 263 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  66.8 
 
 		 263 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  63.88 
 
 		 271 aa  324  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  63.5 
 
 		 268 aa  323  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  63.12 
 
 		 268 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  63.12 
 
 		 268 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  61.42 
 
 		 253 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  61.66 
 
 		 252 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  60.87 
 
 		 252 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  64.75 
 
 		 263 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  60.87 
 
 		 252 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  61.66 
 
 		 252 aa  311  7.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  60.47 
 
 		 252 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  60.8 
 
 		 250 aa  308  9e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  60 
 
 		 260 aa  297  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  60.08 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  59.84 
 
 		 260 aa  293  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  59.84 
 
 		 260 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  53.82 
 
 		 259 aa  292  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  57.77 
 
 		 249 aa  288  9e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  54.15 
 
 		 247 aa  281  9e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  56.13 
 
 		 245 aa  276  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  53.97 
 
 		 247 aa  268  8.999999999999999e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  53.09 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  53.15 
 
 		 247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  52.17 
 
 		 247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  47.81 
 
 		 270 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  48.07 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  49.81 
 
 		 262 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  50 
 
 		 262 aa  235  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  49.81 
 
 		 261 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  52.79 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  50.76 
 
 		 259 aa  227  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  46.77 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  49.6 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  46.32 
 
 		 278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  45.63 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  46.06 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  46.98 
 
 		 248 aa  203  3e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  43.5 
 
 		 236 aa  199  5e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  43.61 
 
 		 293 aa  198  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  44.05 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  44.54 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  45.53 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  47.51 
 
 		 235 aa  188  9e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  49.03 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  45.98 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  45.11 
 
 		 256 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  42.13 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  45.78 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  42.54 
 
 		 245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  41.92 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  44.68 
 
 		 254 aa  162  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  41.04 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  37.94 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  37.94 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  36.73 
 
 		 305 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  36.73 
 
 		 305 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  41.74 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  41.74 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  36.73 
 
 		 305 aa  152  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  36.47 
 
 		 270 aa  151  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0909  signal peptidase I  40.34 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129069  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  37.79 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  37.46 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  43.05 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  38.83 
 
 		 305 aa  149  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  43.75 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  38.26 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  37.98 
 
 		 305 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  38.26 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  38.26 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  37.98 
 
 		 305 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  37.98 
 
 		 305 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  37.98 
 
 		 305 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  38.26 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  38.26 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  38.75 
 
 		 305 aa  148  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  37.92 
 
 		 324 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  37.92 
 
 		 324 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  37.92 
 
 		 324 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  41.44 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  37.91 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  37.33 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  38.62 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  37.41 
 
 		 322 aa  145  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  37.92 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  36.33 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  41.44 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  36.82 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  37.92 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  39.38 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  37.92 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  43.69 
 
 		 284 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  37.92 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  37.92 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  37.87 
 
 		 305 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  37.92 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  41.12 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>