More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2971 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  100 
 
 		 252 aa  517  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  94.84 
 
 		 252 aa  497  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  94.84 
 
 		 252 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  92.46 
 
 		 252 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  89.29 
 
 		 252 aa  481  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  88.54 
 
 		 253 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  87.3 
 
 		 252 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  71.83 
 
 		 250 aa  378  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  61.13 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  63.05 
 
 		 271 aa  322  4e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  62.86 
 
 		 268 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  62.45 
 
 		 268 aa  318  7e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  62.45 
 
 		 268 aa  318  7e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  64.32 
 
 		 263 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  61.66 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  60.08 
 
 		 268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  61.66 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  63.52 
 
 		 263 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  60.87 
 
 		 260 aa  310  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  59.44 
 
 		 263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  61.2 
 
 		 249 aa  301  8.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  59.17 
 
 		 260 aa  285  5e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  55.37 
 
 		 245 aa  275  7e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  53.09 
 
 		 247 aa  273  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  54.29 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  55.46 
 
 		 247 aa  268  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  56.33 
 
 		 247 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  52 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  52.4 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  50.39 
 
 		 279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  49.25 
 
 		 262 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  51.53 
 
 		 252 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  48.13 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  45.83 
 
 		 282 aa  231  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  49.6 
 
 		 259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  48.03 
 
 		 261 aa  222  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  50.66 
 
 		 248 aa  217  2e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  51.15 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  46.85 
 
 		 263 aa  215  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  47.23 
 
 		 278 aa  215  7e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  45.42 
 
 		 293 aa  211  5.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  47.84 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  42.86 
 
 		 255 aa  198  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  45.04 
 
 		 255 aa  194  9e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  47.98 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  44.54 
 
 		 287 aa  191  8e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  48.04 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  44.54 
 
 		 256 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  43.02 
 
 		 256 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  45.95 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  47.27 
 
 		 317 aa  171  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  42.57 
 
 		 290 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  40.15 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  42.79 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  40.25 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  42.08 
 
 		 297 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  39.3 
 
 		 240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  41.63 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  41.18 
 
 		 297 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  41.95 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  41.18 
 
 		 297 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  41.18 
 
 		 297 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  43.29 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  40.54 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  41.32 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  41.32 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  43.27 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  43.9 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  43.9 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  42.34 
 
 		 254 aa  148  8e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  42.65 
 
 		 262 aa  148  9e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  41.83 
 
 		 256 aa  148  9e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  40.28 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  41.18 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  41.18 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  38.06 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  38.31 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  39.91 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  44.98 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  44.02 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  44.02 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  44.02 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  44.02 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  44.02 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  44.02 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  44.02 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  39.81 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  42.57 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  39.91 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  38.61 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  39.91 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  38.29 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  37.79 
 
 		 266 aa  141  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  36.67 
 
 		 305 aa  141  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  37.26 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  38.91 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  36.1 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  35.36 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  38.64 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  39.91 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>