More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0249 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  100 
 
 		 252 aa  510  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  53.85 
 
 		 268 aa  248  9e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  50.59 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  48.81 
 
 		 252 aa  246  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  53.44 
 
 		 268 aa  245  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  53.44 
 
 		 268 aa  245  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  50 
 
 		 253 aa  244  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  52.63 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  49.21 
 
 		 252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  49.17 
 
 		 252 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  49.17 
 
 		 252 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  50.78 
 
 		 263 aa  239  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  51 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  48.35 
 
 		 252 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  50.81 
 
 		 263 aa  234  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  48.21 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  46.94 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  51.34 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  49 
 
 		 249 aa  232  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  48.79 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  48.79 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  50 
 
 		 263 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  46.25 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  46.25 
 
 		 247 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  44.66 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  49.19 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  46.91 
 
 		 260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  47.13 
 
 		 245 aa  218  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  44.66 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  43.8 
 
 		 236 aa  208  7e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  45.49 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  45.49 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  44.36 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  39.43 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  43.87 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  44.75 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  43.46 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  45.18 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  39.3 
 
 		 252 aa  171  7.999999999999999e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  40.67 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  39.53 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  40.25 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  42.98 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  39.72 
 
 		 278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  38.49 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  41.54 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  40.59 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  38.71 
 
 		 286 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  41.3 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  41.3 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  38.78 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  45.59 
 
 		 266 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  39.6 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  38.06 
 
 		 240 aa  141  8e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  40.66 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  40.81 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  44.02 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  43.19 
 
 		 297 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  42.21 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  44.13 
 
 		 284 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  42.6 
 
 		 297 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  42.21 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  42.6 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  38.43 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  38.43 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  42.6 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  42.6 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  43.93 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  34.69 
 
 		 278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  38.19 
 
 		 301 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  40.09 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  39.39 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  40.72 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  42.15 
 
 		 297 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  42.15 
 
 		 297 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  36.73 
 
 		 245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  38.78 
 
 		 269 aa  135  8e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  43.87 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  43.87 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  38.07 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  45.1 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  38.57 
 
 		 317 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  35.66 
 
 		 305 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  39.74 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  37.45 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  39.65 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  41.47 
 
 		 284 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  39.22 
 
 		 254 aa  132  7.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  37.5 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  41.01 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  36.08 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  41.51 
 
 		 284 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  38.72 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  41.51 
 
 		 284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  41.04 
 
 		 284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  38.21 
 
 		 305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  41.98 
 
 		 284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  34.38 
 
 		 310 aa  129  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  40.09 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  38.21 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>