More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1919 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  100 
 
 		 252 aa  521  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  93.65 
 
 		 252 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  89.29 
 
 		 252 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  89.29 
 
 		 252 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  88.49 
 
 		 252 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  86.56 
 
 		 253 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  89.29 
 
 		 252 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  73.02 
 
 		 250 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  61.54 
 
 		 259 aa  327  9e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  63.49 
 
 		 268 aa  325  5e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  63.45 
 
 		 271 aa  322  4e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  62.7 
 
 		 268 aa  321  6e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  62.7 
 
 		 268 aa  321  6e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  63.9 
 
 		 263 aa  316  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  61.66 
 
 		 268 aa  314  9e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  60.87 
 
 		 260 aa  311  4.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  60.87 
 
 		 260 aa  311  4.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  63.52 
 
 		 263 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  61.45 
 
 		 263 aa  309  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  60.16 
 
 		 260 aa  306  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  61.6 
 
 		 249 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  58.26 
 
 		 245 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  55.92 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  54.55 
 
 		 247 aa  278  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  57.44 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  55.79 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  54.96 
 
 		 247 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  50.8 
 
 		 270 aa  252  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  52.4 
 
 		 236 aa  241  1e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  48.71 
 
 		 279 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  48.88 
 
 		 262 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  48.81 
 
 		 252 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  48.89 
 
 		 262 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  46.59 
 
 		 282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  48.09 
 
 		 259 aa  226  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  51.15 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  45.9 
 
 		 261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  46.56 
 
 		 293 aa  218  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  46.64 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  48.63 
 
 		 263 aa  215  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  48.47 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  47.84 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  45.57 
 
 		 287 aa  198  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  43.87 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  48 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  44.66 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  47.55 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  44.57 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  45.8 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  44.59 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  45.05 
 
 		 317 aa  168  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  39.18 
 
 		 278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  39.04 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  41.1 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  42.53 
 
 		 297 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  42.08 
 
 		 297 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  42.08 
 
 		 297 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  42.08 
 
 		 297 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  41.44 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  41.95 
 
 		 270 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  41.18 
 
 		 297 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  41.63 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  41.63 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  41.91 
 
 		 305 aa  149  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  44.55 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  37.83 
 
 		 240 aa  148  9e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  40.61 
 
 		 254 aa  148  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  38.85 
 
 		 305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  39.64 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  41.2 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  41.7 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  43.27 
 
 		 248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  43.27 
 
 		 248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  39.42 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  39.42 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  39.64 
 
 		 322 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  40.09 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  43 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  44.83 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  41.23 
 
 		 262 aa  141  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  42.58 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  42.58 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  42.58 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  42.58 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  42.58 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  42.58 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  35.97 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0909  signal peptidase I  37.4 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  42.58 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  40.91 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  39.37 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  38.11 
 
 		 298 aa  139  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  40.64 
 
 		 297 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  37.59 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  35.61 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  42.58 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  35.61 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  35.61 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  36.49 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  37.55 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>