More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2548 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  100 
 
 		 268 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  100 
 
 		 268 aa  550  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  98.51 
 
 		 268 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  82.13 
 
 		 271 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  77.82 
 
 		 263 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  75.19 
 
 		 263 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  64.49 
 
 		 252 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  62.7 
 
 		 252 aa  322  5e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  62.7 
 
 		 252 aa  321  7e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  63.12 
 
 		 268 aa  321  9.000000000000001e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  63.67 
 
 		 252 aa  318  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  63.27 
 
 		 252 aa  315  5e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  62.85 
 
 		 253 aa  315  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  61.51 
 
 		 263 aa  315  7e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  62.92 
 
 		 250 aa  312  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  62.45 
 
 		 252 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  56.9 
 
 		 245 aa  288  6e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  60.76 
 
 		 260 aa  288  9e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  60.76 
 
 		 260 aa  288  9e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  58 
 
 		 260 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  56.07 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  56.38 
 
 		 249 aa  262  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  52.48 
 
 		 260 aa  255  5e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  52.5 
 
 		 247 aa  255  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  50.97 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  52.7 
 
 		 247 aa  252  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  52.28 
 
 		 247 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  53.44 
 
 		 252 aa  240  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  48.24 
 
 		 270 aa  239  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  47.01 
 
 		 262 aa  218  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  46.99 
 
 		 279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  46.99 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  49.35 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  48.03 
 
 		 259 aa  212  5.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  45.86 
 
 		 282 aa  201  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  46.62 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  45.45 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  45.08 
 
 		 287 aa  195  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  46.82 
 
 		 235 aa  193  3e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  47 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  43.91 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  43.59 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  42.74 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  43.33 
 
 		 286 aa  178  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  44.27 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  43.81 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  40 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  44.69 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  40.15 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  41.56 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  43.58 
 
 		 317 aa  161  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  38.97 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  39.78 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  42.79 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  40.35 
 
 		 245 aa  156  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  42.38 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  40.99 
 
 		 299 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  45.58 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  38.35 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  41.71 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  44.44 
 
 		 266 aa  149  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  42.47 
 
 		 297 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  42.03 
 
 		 256 aa  148  9e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  42.23 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  39.46 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  42.01 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  37.37 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  39.43 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  38.36 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  38.7 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  41.1 
 
 		 324 aa  145  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  41.52 
 
 		 305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  34.9 
 
 		 325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  35.82 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  35.82 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  35.82 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  35.82 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  35.82 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  33.7 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  35.16 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  35.45 
 
 		 324 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  37.14 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  36.19 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  36.19 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  35.45 
 
 		 324 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  36.88 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  36.19 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  36.19 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  36.19 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  35.64 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  37.61 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  37.61 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  34.17 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  35.45 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  41.35 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  34.88 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  40.52 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  33 
 
 		 321 aa  142  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  35.82 
 
 		 301 aa  142  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  39.11 
 
 		 322 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>