More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1005 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  100 
 
 
248 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  100 
 
 
248 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  57.62 
 
 
269 aa  310  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  53.61 
 
 
262 aa  288  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  54.48 
 
 
268 aa  277  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  53.18 
 
 
267 aa  276  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  52.78 
 
 
262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  52.43 
 
 
270 aa  267  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  51.88 
 
 
266 aa  264  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  53.01 
 
 
262 aa  258  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  51.12 
 
 
268 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  50.2 
 
 
255 aa  255  5e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  46.84 
 
 
297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  46.69 
 
 
297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  45.87 
 
 
305 aa  251  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  45.67 
 
 
299 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  50.2 
 
 
256 aa  250  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  52.94 
 
 
251 aa  248  5e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  45.67 
 
 
299 aa  248  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  52.52 
 
 
251 aa  248  7e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  50.36 
 
 
304 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  45.64 
 
 
297 aa  244  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  44.97 
 
 
297 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  44.97 
 
 
297 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  44.97 
 
 
297 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  48.46 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  47.84 
 
 
305 aa  243  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  45.64 
 
 
297 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  45.64 
 
 
297 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  48.52 
 
 
268 aa  242  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  44.63 
 
 
297 aa  241  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  45.82 
 
 
321 aa  241  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  48.2 
 
 
305 aa  241  9e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  50.36 
 
 
305 aa  240  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  48.41 
 
 
263 aa  239  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  47.48 
 
 
305 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  47.48 
 
 
305 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  48.2 
 
 
305 aa  239  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  47.48 
 
 
305 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  47.48 
 
 
305 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  48.57 
 
 
305 aa  238  8e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  48.57 
 
 
305 aa  238  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  48.36 
 
 
305 aa  238  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  47.08 
 
 
256 aa  237  1e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  48.01 
 
 
305 aa  237  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  48 
 
 
305 aa  236  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  51.9 
 
 
342 aa  236  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  47.48 
 
 
305 aa  236  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  46.03 
 
 
256 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  44.41 
 
 
322 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  49.39 
 
 
263 aa  234  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  49.39 
 
 
263 aa  234  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  51.52 
 
 
322 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  44.9 
 
 
321 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  46.64 
 
 
297 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  47.16 
 
 
297 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  47.16 
 
 
297 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  47.16 
 
 
297 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  47.16 
 
 
297 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  47.16 
 
 
297 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  47.16 
 
 
297 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  47.16 
 
 
297 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  47.45 
 
 
304 aa  229  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  51.02 
 
 
257 aa  229  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  53.07 
 
 
324 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  45.21 
 
 
274 aa  227  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1442  Signal peptidase I  49.43 
 
 
264 aa  226  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  52.14 
 
 
284 aa  226  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  45.23 
 
 
284 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  47.15 
 
 
266 aa  226  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  44.56 
 
 
284 aa  225  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  44.21 
 
 
284 aa  224  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  43.58 
 
 
325 aa  225  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  45.96 
 
 
299 aa  224  7e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1373  signal peptidase I  49.05 
 
 
264 aa  224  8e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  44.88 
 
 
284 aa  224  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  45.26 
 
 
299 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  43.05 
 
 
325 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  44.41 
 
 
322 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  45.93 
 
 
300 aa  223  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  46.15 
 
 
298 aa  223  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  45.85 
 
 
304 aa  222  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  44.07 
 
 
322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  48.04 
 
 
283 aa  222  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  52.51 
 
 
284 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  53.42 
 
 
284 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  52.97 
 
 
284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  45.22 
 
 
301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  52.51 
 
 
284 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  41.91 
 
 
322 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  42.24 
 
 
325 aa  216  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  48.47 
 
 
325 aa  216  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  44.78 
 
 
264 aa  216  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  42.05 
 
 
324 aa  214  8e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1084  signal peptidase I  43.71 
 
 
297 aa  214  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365204  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  50 
 
 
284 aa  214  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  42.05 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  43.89 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  42.05 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  50.9 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>