More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2260 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  100 
 
 		 199 aa  408  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  79.9 
 
 		 198 aa  333  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  63.27 
 
 		 200 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  70.1 
 
 		 206 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  64.1 
 
 		 199 aa  267  5.9999999999999995e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  62.81 
 
 		 220 aa  260  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  56.45 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  52.71 
 
 		 216 aa  224  8e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  53.54 
 
 		 225 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  53 
 
 		 219 aa  221  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  53.54 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  54.73 
 
 		 222 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  52.76 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  50.72 
 
 		 221 aa  213  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  50.75 
 
 		 214 aa  211  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  54.46 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0513  signal peptidase I  54.73 
 
 		 216 aa  202  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.124665  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  50.25 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  44.8 
 
 		 288 aa  188  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  41.12 
 
 		 251 aa  175  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  40.65 
 
 		 251 aa  174  5e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  40.72 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  39.29 
 
 		 262 aa  171  9e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  37.4 
 
 		 268 aa  169  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  38.07 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  41.71 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  41.71 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  36.64 
 
 		 276 aa  168  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  37 
 
 		 263 aa  167  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  37 
 
 		 263 aa  167  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  34.73 
 
 		 276 aa  165  5e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  40.29 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  38.53 
 
 		 240 aa  160  8.000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  38.91 
 
 		 266 aa  160  9e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  48.13 
 
 		 173 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  36.94 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  41.87 
 
 		 190 aa  158  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  37.91 
 
 		 274 aa  158  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  34.48 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  40.48 
 
 		 253 aa  156  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  40.66 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  41.49 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  37.5 
 
 		 269 aa  156  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  41.38 
 
 		 268 aa  156  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  33.97 
 
 		 289 aa  155  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  37.02 
 
 		 305 aa  155  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  38.75 
 
 		 247 aa  155  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  39.09 
 
 		 297 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  39.09 
 
 		 297 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  39.09 
 
 		 297 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  39.09 
 
 		 297 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  37.38 
 
 		 284 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  38.68 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  37.38 
 
 		 284 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  38.77 
 
 		 297 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  39.04 
 
 		 322 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  40.17 
 
 		 299 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  38.64 
 
 		 297 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  38.77 
 
 		 297 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  39.44 
 
 		 283 aa  152  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  36.92 
 
 		 284 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  37.17 
 
 		 297 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  36.44 
 
 		 268 aa  151  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  37.99 
 
 		 299 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  36.73 
 
 		 297 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  39.92 
 
 		 305 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  39.92 
 
 		 305 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  37.85 
 
 		 284 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  46.15 
 
 		 171 aa  150  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  37.38 
 
 		 284 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  39.92 
 
 		 305 aa  150  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  35.84 
 
 		 262 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  36.45 
 
 		 284 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  38.5 
 
 		 267 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  33.21 
 
 		 276 aa  149  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  36.8 
 
 		 305 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  32.44 
 
 		 279 aa  149  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  36.8 
 
 		 305 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  36.8 
 
 		 305 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  36.8 
 
 		 305 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  36.92 
 
 		 284 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  36.92 
 
 		 284 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  39.36 
 
 		 176 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  36.51 
 
 		 305 aa  148  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  37.85 
 
 		 284 aa  148  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  36.44 
 
 		 322 aa  148  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  37.85 
 
 		 284 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  34.82 
 
 		 256 aa  148  6e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  34.82 
 
 		 256 aa  148  6e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  38.05 
 
 		 324 aa  147  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  39.23 
 
 		 187 aa  147  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  40 
 
 		 185 aa  147  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  36.8 
 
 		 305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  37.95 
 
 		 304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  38.32 
 
 		 262 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  36.56 
 
 		 305 aa  145  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  37.34 
 
 		 247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  37.44 
 
 		 325 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  38.5 
 
 		 268 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  39.25 
 
 		 300 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>