More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1007 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  100 
 
 		 190 aa  383  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  53.48 
 
 		 219 aa  201  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  52.55 
 
 		 225 aa  198  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  51.02 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  53.59 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  52.25 
 
 		 222 aa  191  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  51.69 
 
 		 226 aa  186  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  48.68 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  46.6 
 
 		 214 aa  174  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  45.21 
 
 		 216 aa  174  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  46.43 
 
 		 219 aa  171  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  44.95 
 
 		 221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  43.92 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  43.85 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  41.87 
 
 		 199 aa  158  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  42.65 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  42.46 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  40.43 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0513  signal peptidase I  45.11 
 
 		 216 aa  140  8e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.124665  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  44.3 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  33.96 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  36.54 
 
 		 240 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  39.39 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  45.7 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  36 
 
 		 251 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  35.78 
 
 		 257 aa  122  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  36 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3855  signal peptidase I  37.7 
 
 		 275 aa  121  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  40.51 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  34.16 
 
 		 256 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  33.17 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  33.17 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  40.51 
 
 		 184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  40.99 
 
 		 173 aa  118  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  31.37 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  37.65 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  33.17 
 
 		 253 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  34.65 
 
 		 270 aa  114  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  34.47 
 
 		 274 aa  115  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  32.13 
 
 		 275 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  34.97 
 
 		 267 aa  112  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  39.29 
 
 		 220 aa  111  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  33.5 
 
 		 263 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  32.67 
 
 		 276 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  36.32 
 
 		 248 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  36.32 
 
 		 248 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  36.63 
 
 		 176 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  37.42 
 
 		 186 aa  110  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3856  signal peptidase I  33.33 
 
 		 265 aa  110  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  30.69 
 
 		 262 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  35.38 
 
 		 342 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  41.22 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  33.01 
 
 		 266 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  35.53 
 
 		 299 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  36.11 
 
 		 214 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  32.13 
 
 		 269 aa  107  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  34.67 
 
 		 268 aa  107  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  34.85 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  32.05 
 
 		 305 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  30.35 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  31.14 
 
 		 247 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  31.2 
 
 		 305 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  36.57 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  33.82 
 
 		 297 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  33.82 
 
 		 297 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  33.33 
 
 		 297 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  33.82 
 
 		 297 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  33.33 
 
 		 297 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  33.82 
 
 		 297 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  31.62 
 
 		 305 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  31.62 
 
 		 305 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  31.62 
 
 		 305 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  31.62 
 
 		 305 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  32.18 
 
 		 256 aa  104  7e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  32.18 
 
 		 256 aa  104  8e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  36.36 
 
 		 262 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  41.72 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  33.33 
 
 		 297 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  39.74 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  31.62 
 
 		 305 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  31.62 
 
 		 305 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  31.62 
 
 		 305 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  34.65 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  39.74 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  35.43 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  35.68 
 
 		 284 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  35.68 
 
 		 284 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  30.6 
 
 		 304 aa  102  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  31.22 
 
 		 276 aa  102  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  32.79 
 
 		 190 aa  101  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  35.08 
 
 		 299 aa  101  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  31.22 
 
 		 305 aa  101  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  33.51 
 
 		 297 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  35.18 
 
 		 284 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  35.94 
 
 		 297 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  35.94 
 
 		 297 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  35.94 
 
 		 297 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  35.94 
 
 		 297 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  35.94 
 
 		 297 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  35.94 
 
 		 297 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>