More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1785 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  100 
 
 		 276 aa  568  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  73.19 
 
 		 276 aa  438  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  72.1 
 
 		 276 aa  421  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  68.84 
 
 		 275 aa  407  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  67.39 
 
 		 289 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  65.82 
 
 		 279 aa  397  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  67.42 
 
 		 268 aa  392  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  35.78 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0210  signal peptidase I  32.51 
 
 		 378 aa  181  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00024847  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6436  signal peptidase I  30.69 
 
 		 393 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000926249  normal  0.474645 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  35.06 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  35.27 
 
 		 216 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0303  hypothetical protein  31.1 
 
 		 364 aa  150  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.318215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  35.47 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  33.21 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  37.29 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  35.07 
 
 		 198 aa  148  7e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  35 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  35.93 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  34.26 
 
 		 225 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  34.26 
 
 		 222 aa  145  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  33.46 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  33.06 
 
 		 221 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  33.45 
 
 		 219 aa  143  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  34.18 
 
 		 199 aa  142  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  32.37 
 
 		 216 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  34.66 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  35.83 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1810  signal peptidase I  28.57 
 
 		 517 aa  140  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  35.6 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  35.57 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  36.4 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  36.29 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  35.34 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  35.5 
 
 		 262 aa  139  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  34.73 
 
 		 255 aa  138  8.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  35.6 
 
 		 297 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  35.6 
 
 		 297 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  35.6 
 
 		 297 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  32.92 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  34.04 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  34.65 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  32.97 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  34.17 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  34.17 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  34.65 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  32.64 
 
 		 270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  32.61 
 
 		 283 aa  135  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3767  signal peptidase I  32.25 
 
 		 380 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0219598  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  32.35 
 
 		 220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  33.73 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  31.65 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  34.21 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  35.96 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  36.44 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  35.39 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  31.52 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  34.89 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  34.89 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  35.71 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  34.91 
 
 		 247 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  34.36 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  33.47 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  33.47 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  33.47 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  33.47 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  33.58 
 
 		 206 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  32.82 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  32.82 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  33.09 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  34.18 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  35.34 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  33.47 
 
 		 322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  35.47 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  32.64 
 
 		 266 aa  129  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  34.78 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  34.1 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  34.1 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  34.1 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  34.1 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  35.11 
 
 		 300 aa  128  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  34.1 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  34.1 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  34.1 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  29.78 
 
 		 214 aa  128  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  33.33 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0840  signal peptidase I  34.75 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00439997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  35.02 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  35.02 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  33.08 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  35.9 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1615  signal peptidase I  35 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  36.96 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  34.48 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  35.4 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  36.28 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  37.34 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  32.69 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  33.61 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  34.02 
 
 		 185 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>