More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2043 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  100 
 
 		 372 aa  755    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2042  signal peptidase I  50.89 
 
 		 356 aa  311  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0210  signal peptidase I  40.92 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00024847  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3528  signal peptidase I  36.41 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4719  signal peptidase I  39.43 
 
 		 389 aa  256  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0211  signal peptidase I  39.63 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000129301  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0245  signal peptidase I  38.42 
 
 		 390 aa  249  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509735 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07095  signal peptidase I  37.98 
 
 		 530 aa  248  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6436  signal peptidase I  38.69 
 
 		 393 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000926249  normal  0.474645 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0303  hypothetical protein  38.72 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.318215 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1810  signal peptidase I  36.1 
 
 		 517 aa  235  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0206  signal peptidase I  39.27 
 
 		 517 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2564  signal peptidase I  37.36 
 
 		 498 aa  229  7e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.57183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2001  signal peptidase I  37.92 
 
 		 465 aa  224  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.220883 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  37.39 
 
 		 275 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  35.89 
 
 		 279 aa  200  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  37.8 
 
 		 268 aa  199  6e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  35.78 
 
 		 276 aa  188  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  37.07 
 
 		 289 aa  188  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  34.4 
 
 		 276 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  34.05 
 
 		 276 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2565  signal peptidase I  28.87 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.871231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1241  signal peptidase I  28.49 
 
 		 343 aa  117  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.824327  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  44.78 
 
 		 219 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  29.77 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  27.86 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  29.48 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  27.86 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  29.19 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  27.86 
 
 		 332 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  41.78 
 
 		 219 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2460  signal peptidase I  25.78 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  44.37 
 
 		 240 aa  104  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  39.73 
 
 		 216 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  40 
 
 		 225 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  28.37 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2196  signal peptidase I  42.45 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  42.11 
 
 		 216 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  44.78 
 
 		 252 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  27.74 
 
 		 269 aa  97.8  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  44.03 
 
 		 252 aa  97.4  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  42.75 
 
 		 225 aa  97.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  42.34 
 
 		 221 aa  97.4  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  45.74 
 
 		 250 aa  97.1  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  35.84 
 
 		 297 aa  97.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  37.5 
 
 		 221 aa  96.7  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  43.28 
 
 		 252 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  44.78 
 
 		 253 aa  96.3  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  35.26 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  33.51 
 
 		 279 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  35.26 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  39.87 
 
 		 198 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  44.03 
 
 		 252 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  35.26 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  35.26 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  42.28 
 
 		 256 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  38.82 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  38.82 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  38.81 
 
 		 293 aa  93.6  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3767  signal peptidase I  36.84 
 
 		 380 aa  93.2  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0219598  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  43.66 
 
 		 268 aa  93.2  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  33.14 
 
 		 324 aa  93.2  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  41.22 
 
 		 263 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  41.98 
 
 		 259 aa  92.8  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  34.52 
 
 		 262 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  41.41 
 
 		 262 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  40.88 
 
 		 220 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1615  signal peptidase I  44.85 
 
 		 339 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  39.1 
 
 		 271 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  40.44 
 
 		 247 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  40.29 
 
 		 247 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  39.57 
 
 		 247 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  41.01 
 
 		 245 aa  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  40.29 
 
 		 247 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  42.65 
 
 		 257 aa  91.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  35.36 
 
 		 288 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  40.38 
 
 		 268 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2245  signal peptidase I  45.8 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0421491  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  32.53 
 
 		 322 aa  91.3  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  36.3 
 
 		 278 aa  90.9  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  41.13 
 
 		 249 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2333  signal peptidase I  45.8 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453212  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  35.46 
 
 		 214 aa  90.9  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  41.35 
 
 		 199 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  41.79 
 
 		 252 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  33.94 
 
 		 325 aa  90.9  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  43.38 
 
 		 268 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  43.38 
 
 		 268 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  34.5 
 
 		 200 aa  90.1  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  44.27 
 
 		 260 aa  89.7  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  44.27 
 
 		 260 aa  89.7  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  42.66 
 
 		 260 aa  89.7  7e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  36.14 
 
 		 263 aa  89.7  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  36.69 
 
 		 259 aa  89.4  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  36.71 
 
 		 270 aa  89.4  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  43.57 
 
 		 263 aa  89.4  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  40.4 
 
 		 222 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  39.84 
 
 		 325 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  38.56 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  43.75 
 
 		 236 aa  88.6  1e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>