More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0210 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0210  signal peptidase I  100 
 
 		 378 aa  782    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00024847  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0211  signal peptidase I  65.46 
 
 		 392 aa  525  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000129301  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0245  signal peptidase I  62.04 
 
 		 390 aa  479  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4719  signal peptidase I  56.33 
 
 		 389 aa  448  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0303  hypothetical protein  45.92 
 
 		 364 aa  362  6e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.318215 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2564  signal peptidase I  47.18 
 
 		 498 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.57183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3528  signal peptidase I  44.16 
 
 		 398 aa  305  8.000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0206  signal peptidase I  42.47 
 
 		 517 aa  287  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2001  signal peptidase I  40.64 
 
 		 465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.220883 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1810  signal peptidase I  41.51 
 
 		 517 aa  284  2.0000000000000002e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07095  signal peptidase I  38.92 
 
 		 530 aa  273  4.0000000000000004e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  40.92 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6436  signal peptidase I  41.19 
 
 		 393 aa  256  7e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000926249  normal  0.474645 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2042  signal peptidase I  36.96 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  32.51 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  30.18 
 
 		 289 aa  177  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2565  signal peptidase I  36.93 
 
 		 302 aa  164  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.871231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  30.05 
 
 		 279 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  37.34 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  38.16 
 
 		 276 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3767  signal peptidase I  27.42 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0219598  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  36.36 
 
 		 275 aa  106  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  38.78 
 
 		 268 aa  106  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  39.63 
 
 		 216 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  26.5 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  35.26 
 
 		 249 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  34.1 
 
 		 219 aa  99.4  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  37.58 
 
 		 219 aa  96.3  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  38.22 
 
 		 221 aa  96.7  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  37.04 
 
 		 216 aa  96.3  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2460  signal peptidase I  25.28 
 
 		 362 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  34.39 
 
 		 225 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  35.29 
 
 		 220 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  34.76 
 
 		 279 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  35.37 
 
 		 214 aa  94.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  32.64 
 
 		 259 aa  93.6  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0365  peptidase S26A, signal peptidase I  28.23 
 
 		 300 aa  93.2  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0331  signal peptidase I  27.63 
 
 		 300 aa  92.8  9e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  33.33 
 
 		 240 aa  92  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  34.48 
 
 		 262 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  36.13 
 
 		 253 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  33.51 
 
 		 268 aa  90.5  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  35.03 
 
 		 225 aa  90.5  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  33.54 
 
 		 247 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  31.34 
 
 		 247 aa  89.7  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  35.71 
 
 		 252 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  35.95 
 
 		 221 aa  89.7  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0831  signal peptidase I  27.01 
 
 		 301 aa  89.4  9e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0438453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1220  signal peptidase I  27.54 
 
 		 306 aa  89.4  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000669884  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  39.86 
 
 		 278 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  34.24 
 
 		 247 aa  89.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  35.29 
 
 		 247 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  34.81 
 
 		 260 aa  88.6  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  31.76 
 
 		 324 aa  88.6  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  35.06 
 
 		 252 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  36.53 
 
 		 260 aa  88.2  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  34.81 
 
 		 260 aa  88.6  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1235  signal peptidase I  26.96 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000420804  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  35.17 
 
 		 259 aa  87.4  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  34.19 
 
 		 252 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  32.57 
 
 		 262 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  34.9 
 
 		 252 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  34.81 
 
 		 260 aa  86.3  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  33.55 
 
 		 252 aa  86.3  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  35.81 
 
 		 199 aa  86.3  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2196  signal peptidase I  35.85 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  34.59 
 
 		 288 aa  85.9  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  33.77 
 
 		 261 aa  85.5  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  36.96 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  33.12 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  35.81 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0782  signal peptidase I  26.57 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0582  signal peptidase I  40.16 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.359862  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  34.36 
 
 		 248 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  34.36 
 
 		 248 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  34.04 
 
 		 263 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  32.67 
 
 		 198 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  38.1 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  26.81 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  36.5 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1005  signal peptidase I  39.17 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  29.57 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  33.1 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0872  signal peptidase I  31.49 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0423773  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  33.79 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  33.74 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  32.14 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  33.33 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  33.54 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  33.54 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  33.54 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  33.56 
 
 		 236 aa  79.3  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  33.54 
 
 		 297 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  33.54 
 
 		 297 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  34.76 
 
 		 226 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  31.75 
 
 		 305 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1615  signal peptidase I  36.18 
 
 		 339 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  37.7 
 
 		 235 aa  79  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  33.54 
 
 		 297 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  33.54 
 
 		 297 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>