258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2460 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2460  signal peptidase I  100 
 
 		 362 aa  743    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0245  signal peptidase I  27.87 
 
 		 390 aa  122  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4719  signal peptidase I  27.64 
 
 		 389 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0206  signal peptidase I  27.49 
 
 		 517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  25.78 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6436  signal peptidase I  27.4 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000926249  normal  0.474645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3528  signal peptidase I  25.6 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2001  signal peptidase I  24.57 
 
 		 465 aa  100  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.220883 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0303  hypothetical protein  26.41 
 
 		 364 aa  100  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.318215 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07095  signal peptidase I  26.81 
 
 		 530 aa  99.8  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0211  signal peptidase I  26.63 
 
 		 392 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000129301  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2564  signal peptidase I  26.77 
 
 		 498 aa  96.7  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.57183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0210  signal peptidase I  25.28 
 
 		 378 aa  95.9  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00024847  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2042  signal peptidase I  26.48 
 
 		 356 aa  89.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1810  signal peptidase I  28.25 
 
 		 517 aa  87  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  23.1 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  24.19 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  24.44 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  24.16 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  24.42 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  25.41 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  25 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  24.44 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2565  signal peptidase I  27.56 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.871231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  25.6 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  22.55 
 
 		 268 aa  67  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0331  signal peptidase I  22.39 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  25.93 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  23.87 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0365  peptidase S26A, signal peptidase I  22.39 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  21.58 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  23.23 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  23.55 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  23.55 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  21.84 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1523  signal peptidase I  23.45 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  25 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  21.77 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1005  signal peptidase I  24.43 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  22.9 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  22.15 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  25.61 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  22.92 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  23.73 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  23.73 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  22.97 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  24.01 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  23.73 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  22.41 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  22.15 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  22.15 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  22.15 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  22.15 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  22.15 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  23.73 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  22.15 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  22.15 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0943  signal peptidase I  24.1 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.416981  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0872  signal peptidase I  24.1 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0423773  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  19.18 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  25.42 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  25.08 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  24.91 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  23.18 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  23.96 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  25.6 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  23.23 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  24.74 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  22.65 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  22.18 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  21.77 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  21.81 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  22.56 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  23.05 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  23.05 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  23.05 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  23.05 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  21.43 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  23.57 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  21.77 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0373  signal peptidase I  24.73 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.444718  hitchhiker  0.000795915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1716  putative signal peptidase I (SPase I) protein  22.41 
 
 		 230 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1241  signal peptidase I  23.62 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.824327  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  24.07 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  25.53 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  25.53 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  20.61 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  22.15 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  23.03 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  23.26 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  23.03 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  23.03 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  23.03 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  23.03 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  38.98 
 
 		 270 aa  57  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  24.43 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  24.43 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  21.36 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  24.68 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  20.78 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>