More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0211 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0211  signal peptidase I  100 
 
 		 392 aa  810    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000129301  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0210  signal peptidase I  65.46 
 
 		 378 aa  525  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00024847  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0245  signal peptidase I  57.14 
 
 		 390 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4719  signal peptidase I  54.45 
 
 		 389 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0303  hypothetical protein  41.71 
 
 		 364 aa  329  4e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.318215 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2564  signal peptidase I  43.73 
 
 		 498 aa  327  3e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.57183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3528  signal peptidase I  43.26 
 
 		 398 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2001  signal peptidase I  40.15 
 
 		 465 aa  293  5e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.220883 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0206  signal peptidase I  41.6 
 
 		 517 aa  284  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1810  signal peptidase I  39.29 
 
 		 517 aa  281  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07095  signal peptidase I  40 
 
 		 530 aa  271  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6436  signal peptidase I  40.9 
 
 		 393 aa  266  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000926249  normal  0.474645 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  39.63 
 
 		 372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2042  signal peptidase I  33.42 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  29.4 
 
 		 289 aa  162  7e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2565  signal peptidase I  32.31 
 
 		 302 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.871231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  29.35 
 
 		 279 aa  137  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  37.93 
 
 		 268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  38.89 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  38.62 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  42.28 
 
 		 276 aa  100  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  37.32 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1220  signal peptidase I  25.92 
 
 		 306 aa  99.4  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000669884  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2460  signal peptidase I  26.63 
 
 		 362 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1235  signal peptidase I  25.35 
 
 		 306 aa  97.4  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000420804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  33.14 
 
 		 216 aa  89.7  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  29.21 
 
 		 225 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  31.21 
 
 		 219 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  34.1 
 
 		 219 aa  87  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  35.19 
 
 		 249 aa  86.3  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  27.96 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  31.4 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  32.52 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  27.96 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  29.57 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  32.93 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  34.81 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  29.59 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  33.13 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  32.78 
 
 		 255 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  33.13 
 
 		 253 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  29.19 
 
 		 259 aa  82  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  28.85 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  30.64 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  32.52 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0831  signal peptidase I  24.79 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0438453  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  32.72 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0326  signal peptidase I  24.28 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  32.72 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  28.65 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  31.43 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  31.9 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  29.53 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  29.52 
 
 		 247 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  32.3 
 
 		 236 aa  79.3  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  31.48 
 
 		 252 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0782  signal peptidase I  25.33 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  31.43 
 
 		 247 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  28.64 
 
 		 263 aa  79  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  32.08 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  28.49 
 
 		 262 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  32.08 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  28.8 
 
 		 214 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1615  signal peptidase I  25.26 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  50 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  28.57 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3767  signal peptidase I  29.71 
 
 		 380 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0219598  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  31.68 
 
 		 247 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2196  signal peptidase I  29.06 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  31.43 
 
 		 271 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  29.17 
 
 		 240 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1241  signal peptidase I  49.25 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.824327  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  33.74 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  28.75 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  29.48 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  50 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  50 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  50 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  50 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  50 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  29.38 
 
 		 250 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  47.69 
 
 		 322 aa  72  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  46.88 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  54.55 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  30 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  26.4 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  46.88 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  45.31 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  29.7 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  30.86 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  29.7 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  45.31 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  45.31 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  32.48 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  28.74 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  40.43 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  30 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  28.96 
 
 		 222 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  30.86 
 
 		 245 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1005  signal peptidase I  29.02 
 
 		 283 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>