More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0326 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0326  signal peptidase I  100 
 
 
321 aa  647    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1220  signal peptidase I  41.4 
 
 
306 aa  238  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000669884  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1235  signal peptidase I  41.11 
 
 
306 aa  236  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000420804  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0652  signal peptidase I  42.81 
 
 
295 aa  216  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1799  signal peptidase I  42.67 
 
 
288 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0193448  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0292  signal peptidase I  27.94 
 
 
432 aa  84.7  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0211  signal peptidase I  24.28 
 
 
392 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000129301  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  23.08 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0210  signal peptidase I  24.58 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00024847  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  25.87 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0303  hypothetical protein  24.45 
 
 
364 aa  72  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.318215 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  25.62 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  25.74 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  24.62 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  34.48 
 
 
198 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  36.5 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  34.19 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0373  signal peptidase I  24.14 
 
 
381 aa  69.3  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.444718  hitchhiker  0.000795915 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  35.45 
 
 
200 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  35.45 
 
 
200 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4719  signal peptidase I  22.84 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898955  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  36.27 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  23.38 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  36.27 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  32.8 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  35.45 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  37.62 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  34.29 
 
 
197 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  24.92 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  34.04 
 
 
173 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2001  signal peptidase I  24.35 
 
 
465 aa  63.9  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.220883 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  24.45 
 
 
276 aa  63.9  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  36.67 
 
 
185 aa  63.9  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  23.05 
 
 
268 aa  62.8  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  33.65 
 
 
190 aa  62.8  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  29.66 
 
 
185 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  25.08 
 
 
262 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  34.65 
 
 
197 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  32.71 
 
 
186 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  28.48 
 
 
217 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  23.25 
 
 
279 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  40.24 
 
 
248 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  40.24 
 
 
248 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  23.13 
 
 
311 aa  61.6  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  28.1 
 
 
192 aa  60.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6436  signal peptidase I  24.87 
 
 
393 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000926249  normal  0.474645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  33.6 
 
 
220 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  30.47 
 
 
190 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1810  signal peptidase I  22.77 
 
 
517 aa  60.5  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  32.17 
 
 
183 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  32.17 
 
 
183 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07511  Signal peptidase I  36.52 
 
 
234 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  31.25 
 
 
290 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  28.7 
 
 
183 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  49.02 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  47.06 
 
 
279 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0206  signal peptidase I  22.53 
 
 
517 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  30.43 
 
 
183 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  32.93 
 
 
184 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  28.21 
 
 
360 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0764  signal peptidase I  35.29 
 
 
221 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179643  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  27.97 
 
 
181 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  28.79 
 
 
284 aa  57.4  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  25.53 
 
 
215 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  41.07 
 
 
213 aa  57  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  30 
 
 
193 aa  57.4  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0365  peptidase S26A, signal peptidase I  22.16 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  32.17 
 
 
183 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  26.95 
 
 
259 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0245  signal peptidase I  24.21 
 
 
390 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00509735 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  27.12 
 
 
338 aa  56.6  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  30.17 
 
 
187 aa  56.6  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  46.81 
 
 
203 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  23.6 
 
 
325 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  48.15 
 
 
342 aa  56.2  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  29.41 
 
 
213 aa  56.6  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0289  signal peptidase, putative  48 
 
 
627 aa  56.2  0.0000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  30.17 
 
 
187 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  47.06 
 
 
299 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  46.3 
 
 
171 aa  56.2  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  30.17 
 
 
187 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  30.17 
 
 
187 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  30.17 
 
 
187 aa  56.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  30.17 
 
 
187 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  30.17 
 
 
187 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  31.3 
 
 
183 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  30.17 
 
 
187 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  46.43 
 
 
322 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  31.3 
 
 
183 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  31.3 
 
 
183 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  31.3 
 
 
183 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0715  signal peptidase I  29.27 
 
 
233 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00052809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  31.3 
 
 
183 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  48.94 
 
 
189 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  31.19 
 
 
221 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  45.95 
 
 
255 aa  55.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  30.17 
 
 
187 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  31.3 
 
 
183 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  46.43 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  30.17 
 
 
187 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>