More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0990 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  100 
 
 
284 aa  578  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  65.78 
 
 
279 aa  295  6e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  63.6 
 
 
267 aa  288  8e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  64.06 
 
 
290 aa  271  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  56.1 
 
 
247 aa  253  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  48.06 
 
 
268 aa  224  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  53.21 
 
 
254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  50.45 
 
 
304 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  53.85 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  48.13 
 
 
290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  51.47 
 
 
291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  48.4 
 
 
243 aa  192  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  43.78 
 
 
360 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  47.8 
 
 
469 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  44.93 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  40.38 
 
 
216 aa  172  6.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  40 
 
 
266 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  44.34 
 
 
298 aa  165  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  42.8 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  47.31 
 
 
269 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  43.75 
 
 
285 aa  162  6e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  38.89 
 
 
338 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  42.92 
 
 
199 aa  159  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  37.45 
 
 
262 aa  151  8.999999999999999e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  44.62 
 
 
225 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  44.1 
 
 
225 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  39.11 
 
 
209 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  40.35 
 
 
213 aa  149  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  44.39 
 
 
434 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  39.47 
 
 
213 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  43.12 
 
 
313 aa  146  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  41.7 
 
 
290 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  38.2 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  41.03 
 
 
289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  43.58 
 
 
219 aa  138  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  38.16 
 
 
311 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  37.73 
 
 
304 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  41.67 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  39.52 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  38.86 
 
 
220 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0179  signal peptidase I  41.67 
 
 
342 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  36.62 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  42.86 
 
 
192 aa  125  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  37.96 
 
 
284 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  37.96 
 
 
284 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  37.96 
 
 
284 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  37.67 
 
 
299 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  36.45 
 
 
341 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  37.83 
 
 
294 aa  122  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  31.71 
 
 
309 aa  118  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  37.12 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  36.19 
 
 
230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  34.63 
 
 
284 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  34.33 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  34.26 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  34.26 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  35.35 
 
 
214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  34.95 
 
 
220 aa  106  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  34.3 
 
 
231 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  35.03 
 
 
230 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  34.31 
 
 
173 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  37.07 
 
 
215 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  36.24 
 
 
214 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09200  signal peptidase I  36.9 
 
 
247 aa  104  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.537704  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  36.59 
 
 
188 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  36.59 
 
 
188 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05490  signal peptidase I  36.22 
 
 
250 aa  102  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  34.33 
 
 
197 aa  102  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05701  Signal peptidase I  31.96 
 
 
219 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  34.9 
 
 
189 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  35.35 
 
 
199 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0514  Signal peptidase I  31.96 
 
 
219 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.299023  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05401  Signal peptidase I  31.94 
 
 
219 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  32.91 
 
 
220 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  32.73 
 
 
185 aa  99.8  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06621  leader peptidase I  35.68 
 
 
194 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.929387  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  34.19 
 
 
221 aa  99.4  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  33.82 
 
 
190 aa  99.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  31.96 
 
 
189 aa  98.6  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  34.17 
 
 
190 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  31.02 
 
 
188 aa  97.4  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05151  Signal peptidase I  33.17 
 
 
238 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.715932  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  33.47 
 
 
222 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06321  leader peptidase I  34.27 
 
 
194 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  32.14 
 
 
219 aa  97.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0606  leader peptidase I  33.33 
 
 
194 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  33.8 
 
 
208 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  34.03 
 
 
185 aa  95.9  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  32.16 
 
 
198 aa  95.9  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  35.12 
 
 
225 aa  95.5  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  33.17 
 
 
197 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  33.16 
 
 
191 aa  95.1  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  35.23 
 
 
217 aa  95.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  30.84 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  32.51 
 
 
181 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05771  Signal peptidase I  31.66 
 
 
211 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  34.7 
 
 
198 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  30.43 
 
 
216 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  32.13 
 
 
216 aa  93.6  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  32.99 
 
 
187 aa  93.2  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>