More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00350 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  100 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  61.88 
 
 		 189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  54.92 
 
 		 188 aa  212  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1382  signal peptidase I  47.15 
 
 		 188 aa  171  6.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813945  normal  0.891342 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  49.13 
 
 		 184 aa  160  8.000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  39.34 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  37.06 
 
 		 197 aa  127  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  37.02 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  41.01 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  45.22 
 
 		 203 aa  124  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  39.46 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  38.98 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  34.27 
 
 		 173 aa  117  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  42.77 
 
 		 200 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  42.86 
 
 		 220 aa  117  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  42.77 
 
 		 200 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  37.5 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  34.44 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  41.45 
 
 		 170 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  38.18 
 
 		 189 aa  114  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  39.06 
 
 		 190 aa  114  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  38.12 
 
 		 313 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  36.49 
 
 		 352 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  39.43 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  39.43 
 
 		 193 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  41.21 
 
 		 171 aa  111  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  35.09 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  32.11 
 
 		 279 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  35.75 
 
 		 291 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  39.77 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  34.65 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  37.5 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  34.84 
 
 		 268 aa  108  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  34.9 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  35.91 
 
 		 360 aa  108  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  36.13 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  35.16 
 
 		 434 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  32.39 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  38.46 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  34 
 
 		 274 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  33.67 
 
 		 221 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  36.22 
 
 		 216 aa  104  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  34.18 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  34.69 
 
 		 213 aa  104  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  40.7 
 
 		 220 aa  104  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  38.86 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  33.14 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  37.84 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  36.81 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  34.76 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  35.26 
 
 		 198 aa  101  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  33.33 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  33.33 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1121  thylakoidal processing peptidase  38.65 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0767152  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  33.33 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  37.71 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  37.7 
 
 		 215 aa  99.8  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  34.76 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  32.27 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  37.63 
 
 		 216 aa  99.8  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  32.27 
 
 		 297 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  35.23 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  32.78 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  32.78 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  36.81 
 
 		 226 aa  99.4  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0913  signal peptidase I  36.84 
 
 		 176 aa  99.4  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0872445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  32.78 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  33.84 
 
 		 221 aa  99.4  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  32.87 
 
 		 294 aa  99  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  36.36 
 
 		 183 aa  98.6  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  32.14 
 
 		 216 aa  99  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  34.87 
 
 		 173 aa  99  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  32.84 
 
 		 288 aa  98.6  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  30.86 
 
 		 284 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  32.3 
 
 		 297 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  32.3 
 
 		 297 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  32.3 
 
 		 297 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3026  signal peptidase I  33.01 
 
 		 262 aa  97.8  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102101  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  32.22 
 
 		 188 aa  97.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  32.3 
 
 		 297 aa  98.2  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  32.04 
 
 		 284 aa  97.8  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  32.3 
 
 		 297 aa  98.2  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06621  leader peptidase I  31.82 
 
 		 194 aa  97.8  8e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.929387  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  32.22 
 
 		 188 aa  97.8  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  34.46 
 
 		 190 aa  97.8  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  36.08 
 
 		 288 aa  97.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  34.51 
 
 		 341 aa  97.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  32.22 
 
 		 187 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  33.53 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  33.04 
 
 		 297 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  32.02 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06321  leader peptidase I  32.32 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  33.02 
 
 		 284 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  33.02 
 
 		 284 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  35.06 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  33.04 
 
 		 297 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0606  leader peptidase I  32.32 
 
 		 194 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  32.77 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  32.22 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  33.66 
 
 		 290 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>