More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2890 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  100 
 
 		 251 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  68.57 
 
 		 254 aa  285  5e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  56.17 
 
 		 290 aa  241  9e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  59.43 
 
 		 243 aa  235  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  55.83 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  52.84 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  53.81 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  50.82 
 
 		 290 aa  218  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  51.3 
 
 		 247 aa  216  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  49.55 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  45.64 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  44.55 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  46.98 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  48.8 
 
 		 469 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  47.37 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  44.08 
 
 		 291 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  47.18 
 
 		 289 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  45.83 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  45 
 
 		 298 aa  168  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  40.93 
 
 		 338 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  42.11 
 
 		 209 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  42.72 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  46.8 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  45.29 
 
 		 199 aa  159  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  44.24 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  45.55 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  49.73 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  36.76 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  40 
 
 		 213 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  41.55 
 
 		 313 aa  143  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  40.43 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  41.28 
 
 		 304 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  40.48 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  39.09 
 
 		 213 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  38.1 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  42.29 
 
 		 289 aa  138  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  41.55 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  39.82 
 
 		 288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  42.15 
 
 		 290 aa  134  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0179  signal peptidase I  40 
 
 		 342 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  42.53 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  41.3 
 
 		 434 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  38.76 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  39.52 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  40.43 
 
 		 352 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  38.33 
 
 		 284 aa  122  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  35.94 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  35.94 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  35.94 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  35.38 
 
 		 341 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  39.56 
 
 		 192 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  32.71 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  34.3 
 
 		 230 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  35.98 
 
 		 190 aa  108  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  35.78 
 
 		 190 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  32.51 
 
 		 198 aa  105  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  29.73 
 
 		 186 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1631  signal peptidase I  37.02 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  32.62 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09200  signal peptidase I  38.83 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.537704  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  33.66 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  34.8 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  35.96 
 
 		 174 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  33.66 
 
 		 192 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  32.91 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  33.66 
 
 		 193 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  36.74 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  32.56 
 
 		 214 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  35.18 
 
 		 200 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  35.18 
 
 		 200 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  35.61 
 
 		 208 aa  98.6  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  35.92 
 
 		 221 aa  98.6  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  33.49 
 
 		 209 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  31.84 
 
 		 309 aa  98.6  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  34.42 
 
 		 225 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  34.8 
 
 		 221 aa  98.2  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  31.19 
 
 		 221 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  35.12 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  29.52 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  28.88 
 
 		 185 aa  95.9  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  34 
 
 		 215 aa  95.5  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  36.79 
 
 		 171 aa  94  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  28.57 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  29.68 
 
 		 216 aa  92  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  34.8 
 
 		 222 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  32.31 
 
 		 263 aa  91.3  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  32.05 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  31.95 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  33 
 
 		 216 aa  90.5  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  32.66 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  32.23 
 
 		 188 aa  90.1  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  32.04 
 
 		 216 aa  89  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3855  signal peptidase I  30.2 
 
 		 275 aa  89  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  31.54 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  27.36 
 
 		 189 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05151  Signal peptidase I  30.73 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.715932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  31.02 
 
 		 215 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  29.63 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  31.54 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  28.29 
 
 		 173 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>