More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0984 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  100 
 
 
291 aa  583  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  67.71 
 
 
289 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  65.53 
 
 
360 aa  360  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  71.71 
 
 
269 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  58.16 
 
 
291 aa  280  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  53.94 
 
 
338 aa  270  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  50.57 
 
 
311 aa  237  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  53.42 
 
 
313 aa  221  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  52.07 
 
 
209 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  47.56 
 
 
290 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  50 
 
 
213 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  48.7 
 
 
213 aa  206  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  53.5 
 
 
434 aa  205  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  51.47 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  47.28 
 
 
267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  45.64 
 
 
469 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  47.56 
 
 
289 aa  196  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  47.51 
 
 
290 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  47.92 
 
 
352 aa  195  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  49.05 
 
 
304 aa  195  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  46.15 
 
 
298 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  51.14 
 
 
220 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  47.69 
 
 
279 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  46.67 
 
 
225 aa  192  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  43.5 
 
 
268 aa  190  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  51.63 
 
 
219 aa  187  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  40.27 
 
 
341 aa  186  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  48.17 
 
 
251 aa  182  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  44.34 
 
 
225 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  42.86 
 
 
304 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  47.3 
 
 
247 aa  179  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  49.55 
 
 
230 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  42.97 
 
 
272 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  38.49 
 
 
299 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  42.86 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  42.52 
 
 
290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  41.83 
 
 
261 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  47.25 
 
 
254 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  45.79 
 
 
243 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  38.39 
 
 
266 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  39.6 
 
 
267 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  37.72 
 
 
216 aa  146  5e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  39.49 
 
 
199 aa  146  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  39.33 
 
 
294 aa  140  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  40.3 
 
 
285 aa  139  7.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  37.36 
 
 
284 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  37.36 
 
 
284 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  37.36 
 
 
284 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  36.79 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  37.21 
 
 
284 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09200  signal peptidase I  37.85 
 
 
247 aa  131  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.537704  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  39.51 
 
 
262 aa  130  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  40.22 
 
 
192 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  36.53 
 
 
214 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  37.33 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  35.71 
 
 
200 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  35.71 
 
 
200 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  36.28 
 
 
184 aa  115  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  36.95 
 
 
197 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  37.33 
 
 
220 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0179  signal peptidase I  38.78 
 
 
342 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  37.25 
 
 
190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  38.16 
 
 
173 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1631  signal peptidase I  35.68 
 
 
288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  35.22 
 
 
216 aa  109  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  38.01 
 
 
190 aa  108  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  34.41 
 
 
221 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  37.5 
 
 
192 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  35.78 
 
 
181 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  39.81 
 
 
221 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  33.91 
 
 
214 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  33.78 
 
 
188 aa  106  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  37.5 
 
 
193 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  37.63 
 
 
174 aa  105  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  36.65 
 
 
191 aa  105  7e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  33.76 
 
 
230 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  33.33 
 
 
231 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  36.65 
 
 
220 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  34.42 
 
 
225 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  36.54 
 
 
171 aa  103  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  34.39 
 
 
219 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  34.88 
 
 
225 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  34.68 
 
 
183 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  34.68 
 
 
183 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  33.78 
 
 
183 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  33.78 
 
 
183 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  33.78 
 
 
183 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  33.78 
 
 
183 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  33.78 
 
 
183 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  33.78 
 
 
183 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  37.02 
 
 
215 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  34.55 
 
 
208 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  33.78 
 
 
183 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  32.73 
 
 
197 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  33.64 
 
 
221 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  32.05 
 
 
215 aa  99.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  33.78 
 
 
184 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2079  thylakoidal processing peptidase  38.02 
 
 
188 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  34.31 
 
 
189 aa  98.6  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  33.5 
 
 
173 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>